data_7SW0

_audit_conform.dict_name      mmcif_pdbx_vrpt.dic
_audit_conform.dict_version   0.068
_audit_conform.dict_location  https://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx_vrpt.dic
#
loop_
_pdbx_vrpt_database.id
_pdbx_vrpt_database.code
PDB   7SW0       
EMDB  EMD-25458  
#
_pdbx_vrpt_exptl.ordinal  1
_pdbx_vrpt_exptl.method   "electron crystallography"
#
_pdbx_vrpt_summary.entry_id                    7SW0
_pdbx_vrpt_summary.PDB_deposition_date         2021-11-19
_pdbx_vrpt_summary.PDB_revision_number         3
_pdbx_vrpt_summary.PDB_revision_date           2024-11-13
_pdbx_vrpt_summary.EMDB_deposition_date        2021-11-19
_pdbx_vrpt_summary.report_creation_date        2025-02-20:17:02
_pdbx_vrpt_summary.attempted_validation_steps  visualanalysis,molprobity,validation-pack,validation_schema,percentiles,writexml,writecif,writepdf
_pdbx_vrpt_summary.ligands_for_buster_report   N
#
loop_
_pdbx_vrpt_entity.id
_pdbx_vrpt_entity.type
_pdbx_vrpt_entity.description
1  polymer  "Proteinase K"  
2  water    water  
#
loop_
_pdbx_vrpt_asym.label_asym_id
_pdbx_vrpt_asym.entity_id
A  1  
B  2  
#
loop_
_pdbx_vrpt_percentile_list.id
_pdbx_vrpt_percentile_list.range
_pdbx_vrpt_percentile_list.exp_method
1  all  pdb  
2  all  "electron microscopy"  
#
loop_
_pdbx_vrpt_percentile_type.id
_pdbx_vrpt_percentile_type.type
1  all_atom_clashscore           
2  Ramachandran_outlier_percent  
3  rotamer_outliers_percent      
#
loop_
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.id
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.percentile_list_id
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.type_id
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.rank
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.number_entries_total
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.res_high
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.res_low
1  1  1   23.88  210492  ?     ?     
2  2  1   26.29   15764  ?     ?     
3  1  2   32.13  207382  ?     ?     
4  2  2   19.45   16835  ?     ?     
5  1  3  100.00  206894  ?     ?     
6  2  3  100.00   16415  ?     ?     
#
loop_
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.ordinal
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.conditions_id
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.type_id
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.label_asym_id
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.PDB_model_num
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.entity_id
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.auth_asym_id
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.rank
1  3  2  A  1  1  A   30.25  
2  4  2  A  1  1  A   54.69  
3  5  3  A  1  1  A  100.00  
4  6  3  A  1  1  A  100.00  
#
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.ordinal          1
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.PDB_model_num    1
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.entity_id        1
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.label_asym_id    A
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.auth_asym_id     A
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.angles_RMSZ      0.49
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.bonds_RMSZ       0.31
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.num_bonds_RMSZ   2068
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.num_angles_RMSZ  2810
#
_pdbx_vrpt_summary_entity_fit_to_map.ordinal        1
_pdbx_vrpt_summary_entity_fit_to_map.PDB_model_num  1
_pdbx_vrpt_summary_entity_fit_to_map.entity_id      1
_pdbx_vrpt_summary_entity_fit_to_map.label_asym_id  A
_pdbx_vrpt_summary_entity_fit_to_map.auth_asym_id   A
_pdbx_vrpt_summary_entity_fit_to_map.Q_score        0.616
#
_pdbx_vrpt_summary_geometry.ordinal                        1
_pdbx_vrpt_summary_geometry.percent_ramachandran_outliers  0.36
_pdbx_vrpt_summary_geometry.percent_rotamer_outliers       0.00
_pdbx_vrpt_summary_geometry.clashscore                     10.60
_pdbx_vrpt_summary_geometry.num_H_reduce                   1932
_pdbx_vrpt_summary_geometry.num_bonds_RMSZ                 2068
_pdbx_vrpt_summary_geometry.bonds_RMSZ                     0.31
_pdbx_vrpt_summary_geometry.num_angles_RMSZ                2810
_pdbx_vrpt_summary_geometry.angles_RMSZ                    0.49
#
_pdbx_vrpt_summary_em.exp_method  "electron crystallography"
_pdbx_vrpt_summary_em.ordinal     1
_pdbx_vrpt_summary_em.Q_score     0.616
#
loop_
_pdbx_vrpt_model_instance.id
_pdbx_vrpt_model_instance.PDB_model_num
_pdbx_vrpt_model_instance.entity_id
_pdbx_vrpt_model_instance.label_asym_id
_pdbx_vrpt_model_instance.label_seq_id
_pdbx_vrpt_model_instance.label_comp_id
_pdbx_vrpt_model_instance.auth_asym_id
_pdbx_vrpt_model_instance.auth_seq_id
_pdbx_vrpt_model_instance.label_alt_id
_pdbx_vrpt_model_instance.PDB_ins_code
_pdbx_vrpt_model_instance.count_clashes
  1  1  1  A    1  ALA  A  106  .  ?        ?  
  2  1  1  A    2  ALA  A  107  .  ?        ?  
  3  1  1  A    3  GLN  A  108  .  ?        ?  
  4  1  1  A    4  THR  A  109  .  ?        ?  
  5  1  1  A    5  ASN  A  110  .  ?        ?  
  6  1  1  A    6  ALA  A  111  .  ?        ?  
  7  1  1  A    7  PRO  A  112  .  ?        1  
  8  1  1  A    8  TRP  A  113  .  ?        ?  
  9  1  1  A    9  GLY  A  114  .  ?        ?  
 10  1  1  A   10  LEU  A  115  .  ?        2  
 11  1  1  A   11  ALA  A  116  .  ?        ?  
 12  1  1  A   12  ARG  A  117  .  ?        ?  
 13  1  1  A   13  ILE  A  118  .  ?        ?  
 14  1  1  A   14  SER  A  119  .  ?        ?  
 15  1  1  A   15  SER  A  120  .  ?        1  
 16  1  1  A   16  THR  A  121  .  ?        ?  
 17  1  1  A   17  SER  A  122  .  ?        1  
 18  1  1  A   18  PRO  A  123  .  ?        ?  
 19  1  1  A   19  GLY  A  124  .  ?        ?  
 20  1  1  A   20  THR  A  125  .  ?        ?  
 21  1  1  A   21  SER  A  126  .  ?        ?  
 22  1  1  A   22  THR  A  127  .  ?        ?  
 23  1  1  A   23  TYR  A  128  .  ?        1  
 24  1  1  A   24  TYR  A  129  .  ?        ?  
 25  1  1  A   25  TYR  A  130  .  ?        ?  
 26  1  1  A   26  ASP  A  131  .  ?        1  
 27  1  1  A   27  GLU  A  132  .  ?        ?  
 28  1  1  A   28  SER  A  133  .  ?        ?  
 29  1  1  A   29  ALA  A  134  .  ?        ?  
 30  1  1  A   30  GLY  A  135  .  ?        ?  
 31  1  1  A   31  GLN  A  136  .  ?        ?  
 32  1  1  A   32  GLY  A  137  .  ?        ?  
 33  1  1  A   33  SER  A  138  .  ?        ?  
 34  1  1  A   34  CYS  A  139  .  ?        1  
 35  1  1  A   35  VAL  A  140  .  ?        1  
 36  1  1  A   36  TYR  A  141  .  ?        ?  
 37  1  1  A   37  VAL  A  142  .  ?        ?  
 38  1  1  A   38  ILE  A  143  .  ?        ?  
 39  1  1  A   39  ASP  A  144  .  ?        ?  
 40  1  1  A   40  THR  A  145  .  ?        ?  
 41  1  1  A   41  GLY  A  146  .  ?        ?  
 42  1  1  A   42  ILE  A  147  .  ?        ?  
 43  1  1  A   43  GLU  A  148  .  ?        ?  
 44  1  1  A   44  ALA  A  149  .  ?        ?  
 45  1  1  A   45  SER  A  150  .  ?        ?  
 46  1  1  A   46  HIS  A  151  .  ?        ?  
 47  1  1  A   47  PRO  A  152  .  ?        ?  
 48  1  1  A   48  GLU  A  153  .  ?        1  
 49  1  1  A   49  PHE  A  154  .  ?        ?  
 50  1  1  A   50  GLU  A  155  .  ?        ?  
 51  1  1  A   51  GLY  A  156  .  ?        ?  
 52  1  1  A   52  ARG  A  157  .  ?        ?  
 53  1  1  A   53  ALA  A  158  .  ?        ?  
 54  1  1  A   54  GLN  A  159  .  ?        ?  
 55  1  1  A   55  MET  A  160  .  ?        ?  
 56  1  1  A   56  VAL  A  161  .  ?        ?  
 57  1  1  A   57  LYS  A  162  .  ?        2  
 58  1  1  A   58  THR  A  163  .  ?        ?  
 59  1  1  A   59  TYR  A  164  .  ?        ?  
 60  1  1  A   60  TYR  A  165  .  ?        ?  
 61  1  1  A   61  TYR  A  166  .  ?        ?  
 62  1  1  A   62  SER  A  167  .  ?        ?  
 63  1  1  A   63  SER  A  168  .  ?        ?  
 64  1  1  A   64  ARG  A  169  .  ?        ?  
 65  1  1  A   65  ASP  A  170  .  ?        1  
 66  1  1  A   66  GLY  A  171  .  ?        ?  
 67  1  1  A   67  ASN  A  172  .  ?        ?  
 68  1  1  A   68  GLY  A  173  .  ?        1  
 69  1  1  A   69  HIS  A  174  .  ?        ?  
 70  1  1  A   70  GLY  A  175  .  ?        ?  
 71  1  1  A   71  THR  A  176  .  ?        ?  
 72  1  1  A   72  HIS  A  177  .  ?        1  
 73  1  1  A   73  CYS  A  178  .  ?        ?  
 74  1  1  A   74  ALA  A  179  .  ?        ?  
 75  1  1  A   75  GLY  A  180  .  ?        1  
 76  1  1  A   76  THR  A  181  .  ?        ?  
 77  1  1  A   77  VAL  A  182  .  ?        1  
 78  1  1  A   78  GLY  A  183  .  ?        ?  
 79  1  1  A   79  SER  A  184  .  ?        3  
 80  1  1  A   80  ARG  A  185  .  ?        ?  
 81  1  1  A   81  THR  A  186  .  ?        ?  
 82  1  1  A   82  TYR  A  187  .  ?        2  
 83  1  1  A   83  GLY  A  188  .  ?        ?  
 84  1  1  A   84  VAL  A  189  .  ?        ?  
 85  1  1  A   85  ALA  A  190  .  ?        ?  
 86  1  1  A   86  LYS  A  191  .  ?        ?  
 87  1  1  A   87  LYS  A  192  .  ?        ?  
 88  1  1  A   88  THR  A  193  .  ?        ?  
 89  1  1  A   89  GLN  A  194  .  ?        ?  
 90  1  1  A   90  LEU  A  195  .  ?        ?  
 91  1  1  A   91  PHE  A  196  .  ?        3  
 92  1  1  A   92  GLY  A  197  .  ?        ?  
 93  1  1  A   93  VAL  A  198  .  ?        1  
 94  1  1  A   94  LYS  A  199  .  ?        ?  
 95  1  1  A   95  VAL  A  200  .  ?        1  
 96  1  1  A   96  LEU  A  201  .  ?        ?  
 97  1  1  A   97  ASP  A  202  .  ?        ?  
 98  1  1  A   98  ASP  A  203  .  ?        ?  
 99  1  1  A   99  ASN  A  204  .  ?        ?  
100  1  1  A  100  GLY  A  205  .  ?        ?  
101  1  1  A  101  SER  A  206  .  ?        ?  
102  1  1  A  102  GLY  A  207  .  ?        ?  
103  1  1  A  103  GLN  A  208  .  ?        ?  
104  1  1  A  104  TYR  A  209  .  ?        ?  
105  1  1  A  105  SER  A  210  .  ?        ?  
106  1  1  A  106  THR  A  211  .  ?        1  
107  1  1  A  107  ILE  A  212  .  ?        1  
108  1  1  A  108  ILE  A  213  .  ?        ?  
109  1  1  A  109  ALA  A  214  .  ?        ?  
110  1  1  A  110  GLY  A  215  .  ?        ?  
111  1  1  A  111  MET  A  216  .  ?        ?  
112  1  1  A  112  ASP  A  217  .  ?        ?  
113  1  1  A  113  PHE  A  218  .  ?        2  
114  1  1  A  114  VAL  A  219  .  ?        ?  
115  1  1  A  115  ALA  A  220  .  ?        ?  
116  1  1  A  116  SER  A  221  .  ?        ?  
117  1  1  A  117  ASP  A  222  .  ?        ?  
118  1  1  A  118  LYS  A  223  .  ?        ?  
119  1  1  A  119  ASN  A  224  .  ?        ?  
120  1  1  A  120  ASN  A  225  .  ?        ?  
121  1  1  A  121  ARG  A  226  .  ?        2  
122  1  1  A  122  ASN  A  227  .  ?        ?  
123  1  1  A  123  CYS  A  228  .  ?        ?  
124  1  1  A  124  PRO  A  229  .  ?        ?  
125  1  1  A  125  LYS  A  230  .  ?        ?  
126  1  1  A  126  GLY  A  231  .  ?        ?  
127  1  1  A  127  VAL  A  232  .  ?        ?  
128  1  1  A  128  VAL  A  233  .  ?        ?  
129  1  1  A  129  ALA  A  234  .  ?        ?  
130  1  1  A  130  SER  A  235  .  ?        ?  
131  1  1  A  131  LEU  A  236  .  ?        ?  
132  1  1  A  132  SER  A  237  .  ?        1  
133  1  1  A  133  LEU  A  238  .  ?        1  
134  1  1  A  134  GLY  A  239  .  ?        ?  
135  1  1  A  135  GLY  A  240  .  ?        ?  
136  1  1  A  136  GLY  A  241  .  ?        ?  
137  1  1  A  137  TYR  A  242  .  ?        ?  
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#
loop_
_pdbx_vrpt_instance_clashes.ordinal
_pdbx_vrpt_instance_clashes.instance_id
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#
loop_
_pdbx_vrpt_model_instance_map_fitting.ordinal
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_pdbx_vrpt_model_instance_map_fitting.Q_score
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