data_4AOB

loop_
_pdbx_vrpt_database.id
_pdbx_vrpt_database.code
PDB   4AOB       
PDBE  EBI-51850  
#
_pdbx_vrpt_exptl.ordinal  1
_pdbx_vrpt_exptl.method   x-ray
#
_pdbx_vrpt_summary.entry_id                    4AOB
_pdbx_vrpt_summary.PDB_deposition_date         2012-03-25
_pdbx_vrpt_summary.PDB_revision_number         3
_pdbx_vrpt_summary.PDB_revision_date           2023-12-20
_pdbx_vrpt_summary.RNA_suiteness               0.38
_pdbx_vrpt_summary.report_creation_date        2024-06-13:06:29
_pdbx_vrpt_summary.attempted_validation_steps  molprobity,validation-pack,xtriage,eds,mogul,buster-report,percentiles,writexml,writecif,writepdf
_pdbx_vrpt_summary.ligands_for_buster_report   Y
#
loop_
_pdbx_vrpt_entity.id
_pdbx_vrpt_entity.type
_pdbx_vrpt_entity.description
1  polymer      "SAM-I RIBOSWITCH"  
2  non-polymer  "BARIUM ION"  
3  non-polymer  "POTASSIUM ION"  
4  non-polymer  "SODIUM ION"  
5  non-polymer  S-ADENOSYLMETHIONINE  
6  water        water  
#
loop_
_pdbx_vrpt_asym.label_asym_id
_pdbx_vrpt_asym.entity_id
A   1  
B   2  
C   2  
D   2  
E   2  
F   2  
G   2  
H   2  
I   2  
J   2  
K   2  
L   2  
M   2  
N   2  
O   3  
P   3  
Q   3  
R   3  
S   3  
T   4  
U   4  
V   3  
W   5  
X   2  
Y   2  
Z   3  
AA  3  
BA  4  
CA  4  
DA  6  
#
loop_
_pdbx_vrpt_percentile_list.id
_pdbx_vrpt_percentile_list.range
_pdbx_vrpt_percentile_list.exp_method
1  all   x-ray  
2  2.95  x-ray  
#
loop_
_pdbx_vrpt_percentile_type.id
_pdbx_vrpt_percentile_type.type
1  all_atom_clashscore    
2  RSRZ_outliers_percent  
3  R_value_R_free         
4  RNAsuiteness_percent   
#
loop_
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.id
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.percentile_list_id
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.type_id
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.rank
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.number_entries_total
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.res_high
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.res_low
1  1  1  10.01  141614     ?     ?  
2  2  1  35.56    3462  2.92  3.00  
3  1  2  80.23  127900     ?     ?  
4  2  2  65.41    2986  2.92  3.00  
5  1  3  68.17  130704     ?     ?  
6  2  3  95.12    3104  2.92  3.00  
7  1  4  20.41    3102     ?     ?  
8  2  4  19.62    1065  2.70  3.22  
#
loop_
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.ordinal
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.conditions_id
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.type_id
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.label_asym_id
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.PDB_model_num
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.entity_id
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.auth_asym_id
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.rank
1  3  2  A  1  1  A  80.23  
2  4  2  A  1  1  A  65.41  
#
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.ordinal          1
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.PDB_model_num    1
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.entity_id        1
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.label_asym_id    A
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.auth_asym_id     A
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.angles_RMSZ      1.41
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.bonds_RMSZ       1.17
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.num_bonds_RMSZ   2269
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.num_angles_RMSZ  3536
#
_pdbx_vrpt_summary_geometry.ordinal          1
_pdbx_vrpt_summary_geometry.clashscore       18.93
_pdbx_vrpt_summary_geometry.num_H_reduce     1039
_pdbx_vrpt_summary_geometry.num_bonds_RMSZ   2269
_pdbx_vrpt_summary_geometry.bonds_RMSZ       1.17
_pdbx_vrpt_summary_geometry.num_angles_RMSZ  3536
_pdbx_vrpt_summary_geometry.angles_RMSZ      1.41
#
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.exp_method                x-ray
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.ordinal                   1
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.Babinet_b                 10.000
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.bulk_solvent_b            54.058
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.Wilson_B_estimate         74.579
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.I_over_sigma              3.40(2.95A)
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.num_miller_indices        6699
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.Babinet_k                 0.003
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.bulk_solvent_k            0.292
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.Padilla_Yeates_L_mean     0.481
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.Padilla_Yeates_L2_mean    0.311
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.Fo_Fc_correlation         0.945
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.DCC_R                     0.17
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.DCC_Rfree                 0.22
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.EDS_R                     0.18
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.EDS_res_high              2.95
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.EDS_res_low               37.98
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.Wilson_B_aniso            "[74.594,74.594,74.546,0.000,0.000,0.000]"
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.data_anisotropy           0.001
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.trans_NCS_details         "The largest off-origin peak in the Patterson function is 5.00% of the height of the origin peak. No significant pseudotranslation is detected."
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.B_factor_type             FULL
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.acentric_outliers         0
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.centric_outliers          1
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.data_completeness         97.92
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.number_reflns_R_free      313
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.percent_free_reflections  4.67
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.percent_RSRZ_outliers     1.06
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.PDB_resolution_high       2.95
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.PDB_resolution_low        50.00
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.PDB_R                     0.19
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.PDB_Rfree                 0.24
#
loop_
_pdbx_vrpt_model_instance.id
_pdbx_vrpt_model_instance.PDB_model_num
_pdbx_vrpt_model_instance.entity_id
_pdbx_vrpt_model_instance.label_asym_id
_pdbx_vrpt_model_instance.label_seq_id
_pdbx_vrpt_model_instance.label_comp_id
_pdbx_vrpt_model_instance.auth_asym_id
_pdbx_vrpt_model_instance.auth_seq_id
_pdbx_vrpt_model_instance.label_alt_id
_pdbx_vrpt_model_instance.PDB_ins_code
_pdbx_vrpt_model_instance.count_bond_outliers
_pdbx_vrpt_model_instance.count_angle_outliers
_pdbx_vrpt_model_instance.count_clashes
_pdbx_vrpt_model_instance.count_mogul_bond_outliers
_pdbx_vrpt_model_instance.count_mogul_angle_outliers
_pdbx_vrpt_model_instance.count_mogul_torsion_outliers
  1  1  1  A    1  G    A     1  .  ?        1     2     ?     ?     ?     ?  
  2  1  1  A    2  G    A     2  .  ?        ?     1     ?     ?     ?     ?  
  3  1  1  A    3  C    A     3  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
  4  1  1  A    4  U    A     4  .  ?        ?     1     ?     ?     ?     ?  
  5  1  1  A    5  U    A     5  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
  6  1  1  A    6  A    A     6  .  ?        1     ?     1     ?     ?     ?  
  7  1  1  A    7  U    A     7  .  ?        ?     1     1     ?     ?     ?  
  8  1  1  A    8  C    A     8  .  ?        1     ?     ?     ?     ?     ?  
  9  1  1  A    9  A    A     9  .  ?        ?     2     1     ?     ?     ?  
 10  1  1  A   10  A    A    10  .  ?        ?     ?     1     ?     ?     ?  
 11  1  1  A   11  G    A    11  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 12  1  1  A   12  A    A    12  .  ?        ?     1     1     ?     ?     ?  
 13  1  1  A   13  G    A    13  .  ?        ?     1     1     ?     ?     ?  
 14  1  1  A   14  A    A    14  .  ?        ?     1     ?     ?     ?     ?  
 15  1  1  A   15  G    A    15  .  ?        ?     ?     1     ?     ?     ?  
 16  1  1  A   16  G    A    16  .  ?        ?     1     ?     ?     ?     ?  
 17  1  1  A   17  G    A    17  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 18  1  1  A   18  C    A    18  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 19  1  1  A   19  A    A    19  .  ?        ?     ?     1     ?     ?     ?  
 20  1  1  A   20  A    A    20  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 21  1  1  A   21  G    A    21  .  ?        ?     1     ?     ?     ?     ?  
 22  1  1  A   22  A    A    22  .  ?        ?     1     1     ?     ?     ?  
 23  1  1  A   23  G    A    23  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 24  1  1  A   24  A    A    24  .  ?        ?     1     2     ?     ?     ?  
 25  1  1  A   25  C    A    25  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 26  1  1  A   26  U    A    26  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 27  1  1  A   27  G    A    27  .  ?        1     ?     ?     ?     ?     ?  
 28  1  1  A   28  G    A    28  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 29  1  1  A   29  C    A    29  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 30  1  1  A   30  U    A    30  .  ?        ?     1     2     ?     ?     ?  
 31  1  1  A   31  U    A    31  .  ?        ?     1     1     ?     ?     ?  
 32  1  1  A   32  G    A    32  .  ?        1     ?     ?     ?     ?     ?  
 33  1  1  A   33  A    A    33  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 34  1  1  A   34  U    A    34  .  ?        ?     1     ?     ?     ?     ?  
 35  1  1  A   35  G    A    35  .  ?        1     4    14     ?     ?     ?  
 36  1  1  A   36  A    A    36  .  ?        ?     ?     1     ?     ?     ?  
 37  1  1  A   37  C    A    37  .  ?        ?     ?     1     ?     ?     ?  
 38  1  1  A   38  C    A    38  .  ?        ?     1     1     ?     ?     ?  
 39  1  1  A   39  C    A    39  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 40  1  1  A   40  C    A    40  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 41  1  1  A   41  C    A    41  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 42  1  1  A   42  G    A    42  .  ?        ?     ?     2     ?     ?     ?  
 43  1  1  A   43  G    A    43  .  ?        ?     ?     4     ?     ?     ?  
 44  1  1  A   44  C    A    44  .  ?        ?     1     3     ?     ?     ?  
 45  1  1  A   45  A    A    45  .  ?        ?     1     1     ?     ?     ?  
 46  1  1  A   46  A    A    46  .  ?        ?     1     1     ?     ?     ?  
 47  1  1  A   47  C    A    47  .  ?        ?     ?     1     ?     ?     ?  
 48  1  1  A   48  C    A    48  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 49  1  1  A   49  A    A    49  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 50  1  1  A   50  A    A    50  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 51  1  1  A   51  A    A    51  .  ?        ?     1     3     ?     ?     ?  
 52  1  1  A   52  A    A    52  .  ?        ?     ?     3     ?     ?     ?  
 53  1  1  A   53  A    A    53  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 54  1  1  A   54  U    A    54  .  ?        ?     2     1     ?     ?     ?  
 55  1  1  A   55  G    A    55  .  ?        ?     ?     3     ?     ?     ?  
 56  1  1  A   56  G    A    56  .  ?        ?     ?     2     ?     ?     ?  
 57  1  1  A   57  U    A    57  .  ?        ?     ?     3     ?     ?     ?  
 58  1  1  A   58  G    A    58  .  ?        ?     ?     1     ?     ?     ?  
 59  1  1  A   59  C    A    59  .  ?        ?     1     ?     ?     ?     ?  
 60  1  1  A   60  C    A    60  .  ?        ?     1     ?     ?     ?     ?  
 61  1  1  A   61  A    A    61  .  ?        ?     3     ?     ?     ?     ?  
 62  1  1  A   62  A    A    62  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 63  1  1  A   63  U    A    63  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 64  1  1  A   64  U    A    64  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 65  1  1  A   65  C    A    65  .  ?        ?     ?     1     ?     ?     ?  
 66  1  1  A   66  C    A    66  .  ?        ?     ?     1     ?     ?     ?  
 67  1  1  A   67  U    A    67  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 68  1  1  A   68  G    A    68  .  ?        ?     2     ?     ?     ?     ?  
 69  1  1  A   69  C    A    69  .  ?        ?     ?     2     ?     ?     ?  
 70  1  1  A   70  A    A    70  .  ?        ?     1     4     ?     ?     ?  
 71  1  1  A   71  G    A    71  .  ?        ?     ?     3     ?     ?     ?  
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 37   37  0.28  Rotameric          ?          11   72.060    22  0.62    34  0.95  molprobity  1.000  
 38   38  0.00  Triaged/NotBinned  ?          11   71.920    22  0.91    34  1.52  molprobity  1.000  
 39   39  0.52  Rotameric          ?          11   79.740    22  0.82    34  0.98  molprobity  1.000  
 40   40  0.36  Rotameric          ?          11   92.120    22  0.47    34  1.06  molprobity  1.000  
 41   41  0.70  Rotameric          ?          11   99.170    22  0.49    34  0.74  molprobity  1.000  
 42   42  0.00  Triaged/NotBinned  ?          11   84.800    26  0.97    41  1.30  molprobity  1.000  
 43   43  0.42  Rotameric          ?          11   80.590    26  0.88    41  1.08  molprobity  1.000  
 44   44  0.64  Rotameric          ?          11   76.380    22  0.87    34  1.28  molprobity  1.000  
 45   45  0.07  Rotameric          ?          11   69.120    25  1.31    39  1.91  molprobity  1.000  
 46   46  0.00  NonRotameric       ?          11   72.920    25  0.98    39  2.14  molprobity  1.000  
 47   47  0.50  Rotameric          ?          11   76.470    22  1.36    34  1.33  molprobity  1.000  
 48   48  0.00  NonRotameric       ?          11   83.390    22  1.19    34  0.62  molprobity  1.000  
 49   49  0.71  Rotameric          ?          11   90.640    25  1.01    39  1.26  molprobity  1.000  
 50   50  0.51  Rotameric          ?          10   99.340    25  0.82    39  1.14  molprobity  1.000  
 51   51  0.06  Rotameric          ?          11  112.320    25  0.94    39  1.27  molprobity  1.000  
 52   52  0.00  NonRotameric       ?          11  105.540    25  0.84    39  0.98  molprobity  1.000  
 53   53  0.00  Triaged/NotBinned  ?          11  109.890    25  0.56    39  0.86  molprobity  1.000  
 54   54  0.09  Rotameric          ?          10   97.140    22  1.10    34  1.86  molprobity  1.000  
 55   55  0.00  Triaged/NotBinned  ?          11   82.030    26  0.86    41  1.51  molprobity  1.000  
 56   56  0.00  Triaged/NotBinned  ?          11   81.900    26  1.05    41  1.26  molprobity  1.000  
 57   57  0.83  Rotameric          ?          10   72.990    22  1.44    34  1.49  molprobity  1.000  
 58   58  0.05  Rotameric          ?          11   57.430    26  1.54    41  1.22  molprobity  1.000  
 59   59  0.64  Rotameric          ?          11   60.640    22  1.26    34  1.55  molprobity  1.000  
 60   60  0.00  Triaged/NotBinned  ?          11   69.110    22  0.89    34  1.31  molprobity  1.000  
 61   61  0.00  NonRotameric       ?          11   63.910    25  1.09    39  1.96  molprobity  1.000  
 62   62  0.55  Rotameric          ?          11   72.180    25  1.08    39  1.16  molprobity  1.000  
 63   63  0.24  Rotameric          ?          10   67.170    22  1.13    34  1.21  molprobity  1.000  
 64   64  0.56  Rotameric          ?          10   54.780    22  1.52    34  1.15  molprobity  1.000  
 65   65  0.00  NonRotameric       ?          11   58.280    22  0.75    34  0.92  molprobity  1.000  
 66   66  0.82  Rotameric          ?          11   58.680    22  1.17    34  1.10  molprobity  1.000  
 67   67  0.01  Rotameric          ?          10   64.950    22  1.07    34  0.96  molprobity  1.000  
 68   68  0.01  Rotameric          outlier    11   72.420    26  1.03    41  2.16  molprobity  1.000  
 69   69  0.00  Triaged/NotBinned  ?          11   77.910    22  1.16    34  1.36  molprobity  1.000  
 70   70  0.92  Rotameric          ?          11   72.460    25  1.16    39  1.37  molprobity  1.000  
 71   71  0.53  Rotameric          ?          11   73.380    26  1.51    41  1.14  molprobity  1.000  
 72   72  0.59  Rotameric          ?          11   82.380    25  1.40    39  1.74  molprobity  1.000  
 73   73  0.38  Rotameric          ?          11   67.030    26  1.02    41  1.30  molprobity  1.000  
 74   74  0.68  Rotameric          ?          11   70.560    26  1.28    41  1.51  molprobity  1.000  
 75   75  0.02  Rotameric          outlier    11   79.170    25  1.35    39  1.72  molprobity  1.000  
 76   76  0.00  Triaged/NotBinned  ?          11   69.500    25  1.36    39  1.56  molprobity  1.000  
 77   77  0.52  Rotameric          ?          11   64.310    25  0.96    39  1.12  molprobity  1.000  
 78   78  0.42  Rotameric          ?          11   53.490    22  1.43    34  1.63  molprobity  1.000  
 79   79  0.39  Rotameric          ?          11   61.640    26  0.85    41  1.38  molprobity  1.000  
 80   80  0.68  Rotameric          ?          10   63.800    22  0.82    34  1.15  molprobity  1.000  
 81   81  0.57  Rotameric          ?          10   69.240    22  1.13    34  1.09  molprobity  1.000  
 82   82  0.68  Rotameric          ?          11   74.790    26  1.25    41  1.30  molprobity  1.000  
 83   83  0.00  Triaged/NotBinned  ?          11   84.840    25  1.42    39  1.62  molprobity  1.000  
 84   84  0.46  Rotameric          ?          11   70.610    25  1.64    39  1.46  molprobity  1.000  
 85   85  0.89  Rotameric          ?          11   69.650    25  0.71    39  1.32  molprobity  1.000  
 86   86  0.40  Rotameric          ?          11   58.900    26  1.14    41  1.26  molprobity  1.000  
 87   87  0.00  Triaged/NotBinned  ?          11   51.080    25  1.12    39  1.08  molprobity  1.000  
 88   88  0.00  NonRotameric       ?          10   53.310    22  1.46    34  1.56  molprobity  1.000  
 89   89  0.27  Rotameric          ?          11   56.380    26  1.36    41  1.16  molprobity  1.000  
 90   90  0.48  Rotameric          ?          11   59.480    25  1.73    39  1.99  molprobity  1.000  
 91   91  0.21  Rotameric          ?          11   60.760    26  1.38    41  1.52  molprobity  1.000  
 92   92  0.00  NonRotameric       ?          11   55.800    22  0.92    34  0.86  molprobity  1.000  
 93   93  0.34  Rotameric          ?          11   58.190    22  1.65    34  0.94  molprobity  1.000  
 94   94  0.44  Rotameric          ?          12   68.240    24  1.27    35  0.95  molprobity  1.000  
 95   95     ?  ?                  ?           ?  104.500     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
 96   96     ?  ?                  ?           ?  130.480     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
 97   97     ?  ?                  ?           ?   95.810     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
 98   98     ?  ?                  ?           ?  105.300     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
 99   99     ?  ?                  ?           ?  112.440     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
100  100     ?  ?                  ?           ?  138.570     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
101  101     ?  ?                  ?           ?  118.500     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
102  102     ?  ?                  ?           ?  116.590     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
103  103     ?  ?                  ?           ?  135.490     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
104  104     ?  ?                  ?           ?   90.440     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
105  105     ?  ?                  ?           ?  127.850     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
106  106     ?  ?                  ?           ?  144.910     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
107  107     ?  ?                  ?           ?  121.790     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
108  108     ?  ?                  ?           ?   57.360     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
109  109     ?  ?                  ?           ?   77.140     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
110  110     ?  ?                  ?           ?   78.760     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
111  111     ?  ?                  ?           ?  101.180     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
112  112     ?  ?                  ?           ?   88.970     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
113  113     ?  ?                  ?           ?   74.660     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
114  114     ?  ?                  ?           ?   65.310     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
115  115     ?  ?                  ?           ?   73.020     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
116  116     ?  ?                  ?          20   62.720    23  2.54    20  2.13  mogul       1.000  
117  117     ?  ?                  ?           ?  102.160     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
118  118     ?  ?                  ?           ?  190.730     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
119  119     ?  ?                  ?           ?   82.420     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
120  120     ?  ?                  ?           ?   92.160     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
121  121     ?  ?                  ?           ?   58.650     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
122  122     ?  ?                  ?           ?   63.190     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
123  123     ?  ?                  ?           ?   40.100     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
124  124     ?  ?                  ?           ?   26.510     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
125  125     ?  ?                  ?           ?   30.350     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
126  126     ?  ?                  ?           ?   31.380     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
127  127     ?  ?                  ?           ?   51.900     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
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129  129     ?  ?                  ?           ?   31.250     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
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#
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_pdbx_vrpt_instance_clashes.ordinal
_pdbx_vrpt_instance_clashes.instance_id
_pdbx_vrpt_instance_clashes.label_atom_id
_pdbx_vrpt_instance_clashes.cid
_pdbx_vrpt_instance_clashes.clashmag
_pdbx_vrpt_instance_clashes.dist
  1    6  "H2'"    1  0.42  2.19  
  2    7  "O4'"    1  0.42  2.19  
  3    9  "H4'"    2  0.71  1.90  
  4   10  OP2      2  0.71  1.90  
  5   12  N3       3  0.45  2.31  
  6   13  C2       4  0.51  2.79  
  7   15  N7       4  0.51  2.79  
  8   19  N1       5  0.74  2.18  
  9   22  C2       6  0.43  2.72  
 10   24  H8       7  0.56  1.88  
 11   24  OP2      7  0.56  1.88  
 12   30  "H2'"    8  0.43  2.19  
 13   30  O2       8  0.43  2.19  
 14   31  O2       6  0.43  2.72  
 15   35  C8       9  1.20  1.77  
 16   35  C8      10  0.70  2.67  
 17   35  "H5''"   9  1.20  1.77  
 18   35  "H5''"  11  1.09  1.05  
 19   35  OP1     12  1.15  1.95  
 20   35  OP1     13  1.00  1.06  
 21   35  "C4'"   12  1.15  1.95  
 22   35  H8      11  1.09  1.05  
 23   35  H8      14  0.79  1.92  
 24   35  "H4'"   13  1.00  1.06  
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 26   35  "C5'"   10  0.70  2.67  
 27   35  "O2'"    5  0.74  2.18  
 28   35  "O2'"   15  0.44  2.36  
 29   36  OP2     15  0.44  2.36  
 30   37  C5      16  0.41  3.09  
 31   38  C4      16  0.41  3.09  
 32   42  "H5''"  17  0.53  2.08  
 33   42  "H3'"   18  0.44  1.81  
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 35   43  "H2'"   20  0.47  2.49  
 36   43  OP2     17  0.53  2.08  
 37   43  H8      18  0.44  1.81  
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 48   52  OP2     25  0.40  2.03  
 49   52  H8      25  0.40  2.03  
 50   54  "H2'"   26  0.41  2.19  
 51   55  "H2'"   27  0.70  1.74  
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 53   55  "O4'"   26  0.41  2.19  
 54   56  "H5'"   27  0.70  1.74  
 55   56  "H5'"   28  0.62  2.28  
 56   57  N3      29  1.11  1.64  
 57   57  H3      30  0.99  1.75  
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 90   80  "H2'"   48  0.60  2.37  
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103   93  H6      54  0.51  1.93  
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105   94  H8      55  0.65  1.80  
106   94  "O5'"   55  0.65  1.80  
107  116  H2      29  1.11  1.64  
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113  116  "H2'"   22  0.51  2.10  
114  116  "C3'"   57  0.50  2.42  
115  116  "C3'"   58  0.41  2.97  
116  116  C8      58  0.41  2.97  
#
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_pdbx_vrpt_instance_intra_bond_outliers.Z
_pdbx_vrpt_instance_intra_bond_outliers.link
 1   1  OP3    P    1.511  1.607  0.012  -7.96  ?     
 2   6  "O3'"  P    1.544  1.607  0.012  -5.24  Y     
 3   8  "O3'"  P    1.672  1.607  0.012   5.45  Y     
 4  27  "O3'"  P    1.670  1.607  0.012   5.24  Y     
 5  32  P      OP1  1.570  1.485  0.017   5.00  ?     
 6  35  "O3'"  P    1.683  1.607  0.012   6.29  Y     
 7  83  "O3'"  P    1.545  1.607  0.012  -5.17  Y     
 8  84  "O3'"  P    1.535  1.607  0.012  -6.03  Y     
 9  88  "O3'"  P    1.543  1.607  0.012  -5.36  Y     
10  90  P      OP2  1.594  1.485  0.017   6.39  ?     
#
loop_
_pdbx_vrpt_instance_intra_angle_outliers.ordinal
_pdbx_vrpt_instance_intra_angle_outliers.instance_id
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_pdbx_vrpt_instance_intra_angle_outliers.stdev
_pdbx_vrpt_instance_intra_angle_outliers.Z
_pdbx_vrpt_instance_intra_angle_outliers.link
 1   1  P      "O3'"  "C3'"  106.011  119.700  1.200  -11.41  Y     
 2   1  "O5'"  P      OP2    116.787  110.700  1.200    5.07  ?     
 3   2  "O5'"  P      OP1     99.372  105.700  0.900   -7.03  ?     
 4   4  P      "O3'"  "C3'"  113.526  119.700  1.200   -5.14  Y     
 5   7  OP2    P      "O3'"  119.113  105.200  2.200    6.32  Y     
 6   9  OP1    P      "O3'"  121.127  105.200  2.200    7.24  Y     
 7   9  P      "O3'"  "C3'"  126.104  119.700  1.200    5.34  Y     
 8  12  "O5'"  P      OP2    117.146  110.700  1.200    5.37  ?     
 9  13  "C3'"  "C2'"  "O2'"   97.851  113.300  2.900   -5.33  ?     
10  14  "O4'"  "C1'"  N9     112.375  108.200  0.800    5.22  ?     
11  16  P      "O3'"  "C3'"  112.110  119.700  1.200   -6.33  Y     
12  21  "C5'"  "C4'"  "O4'"  116.364  109.100  1.200    6.05  ?     
13  22  P      "O3'"  "C3'"  112.570  119.700  1.200   -5.94  Y     
14  24  "O5'"  P      OP1    120.237  110.700  1.200    7.95  ?     
15  30  P      "O3'"  "C3'"  111.948  119.700  1.200   -6.46  Y     
16  31  P      "O3'"  "C3'"  113.506  119.700  1.200   -5.16  Y     
17  34  OP2    P      "O3'"  117.612  105.200  2.200    5.64  Y     
18  35  OP2    P      "O3'"  117.938  105.200  2.200    5.79  Y     
19  35  "O4'"  "C4'"  "C3'"   98.553  104.000  1.000   -5.45  ?     
20  35  "O5'"  P      OP1     98.905  105.700  0.900   -7.55  ?     
21  35  "O5'"  P      OP2     99.240  105.700  0.900   -7.18  ?     
22  38  P      "O3'"  "C3'"  110.831  119.700  1.200   -7.39  Y     
23  44  "O5'"  P      OP1    100.335  105.700  0.900   -5.96  ?     
24  45  P      "O3'"  "C3'"  112.797  119.700  1.200   -5.75  Y     
25  46  "O5'"  P      OP2     94.951  105.700  0.900  -11.94  ?     
26  51  P      "O3'"  "C3'"  113.341  119.700  1.200   -5.30  Y     
27  54  P      "O3'"  "C3'"  113.320  119.700  1.200   -5.32  Y     
28  54  "C4'"  "C3'"  "O3'"  125.379  113.000  2.000    6.19  ?     
29  59  "O5'"  P      OP1    100.020  105.700  0.900   -6.31  ?     
30  60  OP1    P      "O3'"  117.123  105.200  2.200    5.42  Y     
31  61  P      "O3'"  "C3'"  109.517  119.700  1.200   -8.49  Y     
32  61  "O5'"  P      OP1    101.143  105.700  0.900   -5.06  ?     
33  61  "O5'"  P      OP2    117.980  110.700  1.200    6.07  ?     
34  68  OP1    P      "O3'"  121.068  105.200  2.200    7.21  Y     
35  68  P      "O3'"  "C3'"  127.542  119.700  1.200    6.54  Y     
36  70  "O5'"  P      OP1    116.902  110.700  1.200    5.17  ?     
37  72  P      "O3'"  "C3'"  113.265  119.700  1.200   -5.36  Y     
38  75  "O3'"  P      "O5'"  114.760  104.000  1.900    5.66  Y     
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3  eds          2.36.2                                                                Y  
4  dcc          '"2.27  (2023-04-10)"'                                                Y  
5  xtriage      1.20.1                                                                Y  
6  percentiles  "20191225.v01 (using entries in the PDB archive December 25th 2019)"  Y  
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