data_2O2M

_pdbx_vrpt_database.id    PDB
_pdbx_vrpt_database.code  2O2M
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_pdbx_vrpt_exptl.method   nmr
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_pdbx_vrpt_summary.entry_id                    2O2M
_pdbx_vrpt_summary.PDB_deposition_date         2006-11-30
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_pdbx_vrpt_summary.PDB_revision_date           2022-03-16
_pdbx_vrpt_summary.report_creation_date        2022-03-06:21:47
_pdbx_vrpt_summary.attempted_validation_steps  mogul,buster-report,molprobity,validation-pack,coreclust,chemicalshifts,percentiles,writepdf,writexml,writecif
_pdbx_vrpt_summary.ligands_for_buster_report   Y
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loop_
_pdbx_vrpt_entity.id
_pdbx_vrpt_entity.type
_pdbx_vrpt_entity.description
1  polymer      "Apoptosis regulator Bcl-X"  
2  non-polymer  4-(4-BENZYL-4-METHOXYPIPERIDIN-1-YL)-N-[(4-{[1,1-DIMETHYL-2-(PHENYLTHIO)ETHYL]AMINO}-3-NITROPHENYL)SULFONYL]BENZAMIDE  
#
loop_
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_pdbx_vrpt_asym.entity_id
A  1  
B  2  
#
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_pdbx_vrpt_percentile_list.exp_method
1  all  pdb    
2  nmr  x-ray  
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_pdbx_vrpt_percentile_type.id    1
_pdbx_vrpt_percentile_type.type  all_atom_clashscore
#
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_pdbx_vrpt_percentile_conditions.res_low
1  1  1   99.94  158937  ?     ?     
2  2  1  100.00   12864  ?     ?     
#
loop_
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.ordinal
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.PDB_model_num
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.entity_id
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_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.auth_asym_id
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.angles_RMSZ
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_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.num_bonds_RMSZ
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.num_angles_RMSZ
1  1  1  A  A  0.39  0.41  1162  1568  
2  1  2  B  A     ?     ?     ?     ?  
#
_pdbx_vrpt_summary_geometry.ordinal                                    1
_pdbx_vrpt_summary_geometry.percent_ramachandran_outliers_full_length  4.20
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_pdbx_vrpt_summary_geometry.num_H_reduce                               1117
_pdbx_vrpt_summary_geometry.num_bonds_RMSZ                             1162
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_pdbx_vrpt_summary_geometry.angles_RMSZ                                0.39
#
loop_
_pdbx_vrpt_model_instance.id
_pdbx_vrpt_model_instance.PDB_model_num
_pdbx_vrpt_model_instance.entity_id
_pdbx_vrpt_model_instance.label_asym_id
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_pdbx_vrpt_model_instance.auth_seq_id
_pdbx_vrpt_model_instance.label_alt_id
_pdbx_vrpt_model_instance.PDB_ins_code
_pdbx_vrpt_model_instance.count_bond_outliers
_pdbx_vrpt_model_instance.count_angle_outliers
_pdbx_vrpt_model_instance.count_clashes
_pdbx_vrpt_model_instance.count_mogul_bond_outliers
_pdbx_vrpt_model_instance.count_mogul_angle_outliers
_pdbx_vrpt_model_instance.count_mogul_torsion_outliers
  1  1  1  A    1  SER  A     6  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
  2  1  1  A    2  GLN  A     7  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
  3  1  1  A    3  SER  A     8  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
  4  1  1  A    4  ASN  A     9  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
  5  1  1  A    5  ARG  A    10  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
  6  1  1  A    6  GLU  A    11  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
  7  1  1  A    7  LEU  A    12  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
  8  1  1  A    8  VAL  A    13  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
  9  1  1  A    9  VAL  A    14  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 10  1  1  A   10  ASP  A    15  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 11  1  1  A   11  PHE  A    16  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 12  1  1  A   12  LEU  A    17  .  ?        ?     ?     1     ?     ?     ?  
 13  1  1  A   13  SER  A    18  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 14  1  1  A   14  TYR  A    19  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 15  1  1  A   15  LYS  A    20  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 16  1  1  A   16  LEU  A    21  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 17  1  1  A   17  SER  A    22  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 18  1  1  A   18  GLN  A    23  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 19  1  1  A   19  LYS  A    24  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 20  1  1  A   20  GLY  A    25  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 21  1  1  A   21  TYR  A    26  .  ?        ?     ?     1     ?     ?     ?  
 22  1  1  A   22  SER  A    27  .  ?        ?     ?     1     ?     ?     ?  
 23  1  1  A   23  ALA  A    28  .  ?        ?     ?     1     ?     ?     ?  
 24  1  1  A   24  GLY  A    29  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 25  1  1  A   25  GLY  A    30  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 26  1  1  A   26  GLY  A    31  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 27  1  1  A   27  GLY  A    32  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 28  1  1  A   28  GLY  A    33  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 29  1  1  A   29  GLY  A    34  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 30  1  1  A   30  GLY  A    35  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 31  1  1  A   31  GLY  A    36  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 32  1  1  A   32  MET  A    37  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 33  1  1  A   33  ALA  A    38  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 34  1  1  A   34  ALA  A    89  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 35  1  1  A   35  VAL  A    90  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 36  1  1  A   36  LYS  A    91  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 37  1  1  A   37  GLN  A    92  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 38  1  1  A   38  ALA  A    93  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 39  1  1  A   39  LEU  A    94  .  ?        ?     ?     2     ?     ?     ?  
 40  1  1  A   40  ARG  A    95  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 41  1  1  A   41  GLU  A    96  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 42  1  1  A   42  ALA  A    97  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 43  1  1  A   43  GLY  A    98  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 44  1  1  A   44  ASP  A    99  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 45  1  1  A   45  GLU  A   100  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 46  1  1  A   46  PHE  A   101  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 47  1  1  A   47  GLU  A   102  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 48  1  1  A   48  LEU  A   103  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 49  1  1  A   49  ARG  A   104  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 50  1  1  A   50  TYR  A   105  .  ?        ?     ?     2     ?     ?     ?  
 51  1  1  A   51  ARG  A   106  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 52  1  1  A   52  ARG  A   107  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 53  1  1  A   53  ALA  A   108  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 54  1  1  A   54  PHE  A   109  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 55  1  1  A   55  SER  A   110  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 56  1  1  A   56  ASP  A   111  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 57  1  1  A   57  LEU  A   112  .  ?        ?     ?     2     ?     ?     ?  
 58  1  1  A   58  THR  A   113  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 59  1  1  A   59  SER  A   114  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 60  1  1  A   60  GLN  A   115  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 61  1  1  A   61  LEU  A   116  .  ?        ?     ?     3     ?     ?     ?  
 62  1  1  A   62  HIS  A   117  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 63  1  1  A   63  ILE  A   118  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 64  1  1  A   64  THR  A   119  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 65  1  1  A   65  PRO  A   120  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 66  1  1  A   66  GLY  A   121  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 67  1  1  A   67  THR  A   122  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 68  1  1  A   68  ALA  A   123  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 69  1  1  A   69  TYR  A   124  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 70  1  1  A   70  GLN  A   125  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 71  1  1  A   71  SER  A   126  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 72  1  1  A   72  PHE  A   127  .  ?        ?     ?     2     ?     ?     ?  
 73  1  1  A   73  GLU  A   128  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 74  1  1  A   74  GLN  A   129  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 75  1  1  A   75  VAL  A   130  .  ?        ?     ?     3     ?     ?     ?  
 76  1  1  A   76  VAL  A   131  .  ?        ?     ?     2     ?     ?     ?  
 77  1  1  A   77  ASN  A   132  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 78  1  1  A   78  GLU  A   133  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 79  1  1  A   79  LEU  A   134  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 80  1  1  A   80  PHE  A   135  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 81  1  1  A   81  ARG  A   136  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 82  1  1  A   82  ASP  A   137  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 83  1  1  A   83  GLY  A   138  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 84  1  1  A   84  VAL  A   139  .  ?        ?     ?     1     ?     ?     ?  
 85  1  1  A   85  ASN  A   140  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 86  1  1  A   86  TRP  A   141  .  ?        ?     ?     1     ?     ?     ?  
 87  1  1  A   87  GLY  A   142  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 88  1  1  A   88  ARG  A   143  .  ?        ?     ?     1     ?     ?     ?  
 89  1  1  A   89  ILE  A   144  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 90  1  1  A   90  VAL  A   145  .  ?        ?     ?     2     ?     ?     ?  
 91  1  1  A   91  ALA  A   146  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 92  1  1  A   92  PHE  A   147  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 93  1  1  A   93  PHE  A   148  .  ?        ?     ?     2     ?     ?     ?  
 94  1  1  A   94  SER  A   149  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 95  1  1  A   95  PHE  A   150  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 96  1  1  A   96  GLY  A   151  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 97  1  1  A   97  GLY  A   152  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 98  1  1  A   98  ALA  A   153  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
 99  1  1  A   99  LEU  A   154  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
100  1  1  A  100  CYS  A   155  .  ?        ?     ?     3     ?     ?     ?  
101  1  1  A  101  VAL  A   156  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
102  1  1  A  102  GLU  A   157  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
103  1  1  A  103  SER  A   158  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
104  1  1  A  104  VAL  A   159  .  ?        ?     ?     2     ?     ?     ?  
105  1  1  A  105  ASP  A   160  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
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107  1  1  A  107  GLU  A   162  .  ?        1     ?     ?     ?     ?     ?  
108  1  1  A  108  MET  A   163  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
109  1  1  A  109  GLN  A   164  .  ?        ?     ?     1     ?     ?     ?  
110  1  1  A  110  VAL  A   165  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
111  1  1  A  111  LEU  A   166  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
112  1  1  A  112  VAL  A   167  .  ?        ?     ?     1     ?     ?     ?  
113  1  1  A  113  SER  A   168  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
114  1  1  A  114  ARG  A   169  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
115  1  1  A  115  ILE  A   170  .  ?        ?     ?     1     ?     ?     ?  
116  1  1  A  116  ALA  A   171  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
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118  1  1  A  118  TRP  A   173  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
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130  1  1  A  130  TRP  A   185  .  ?        ?     ?     1     ?     ?     ?  
131  1  1  A  131  ILE  A   186  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
132  1  1  A  132  GLN  A   187  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?     ?  
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146  1  2  B    .  LI0  A  1000  .  ?        ?     ?     7     6     8     4  
#
loop_
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1  146  C3   C2   C1   105.61  109.56    89  1.29  -3.05  0.56  
2  146  C4   N1   C6   126.90  118.09  1696  2.70   3.26  0.04  
3  146  C5   N1   C6   125.38  118.09  1696  2.70   2.70  0.01  
4  146  C7   C6   N1   118.52  121.38  7895  1.38  -2.08  0.00  
5  146  C10  N2   S14  118.82  123.36   110  1.29  -3.52  1.10  
6  146  C13  C14  N4   120.64  123.35    77  1.02  -2.66  0.07  
7  146  O24  N3   C13  115.27  119.03    25  1.71  -2.20  1.20  
8  146  C29  O5   C2   109.44  116.81    22  1.01  -7.27  5.26  
#
loop_
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1  146  C19  C20  S1   C18  110.19  68.57  2234  28.58  0.29  2.91  
2  146  C21  C20  S1   C18  -69.75  68.47  2234  29.53  0.18  4.21  
3  146  C2   C30  C34  C33  -47.07  43.41   618  14.68  0.11  0.97  
4  146  C2   C30  C34  C35  133.65  43.56   618  14.55  0.48  1.29  
#
loop_
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_pdbx_vrpt_software.success_y_or_n
1  molprobity   4.02b-467                                                             Y  
2  mogul        "1.8.5 (274361), CSD as541be (2020)"                                  Y  
3  percentiles  "20191225.v01 (using entries in the PDB archive December 25th 2019)"  N  
##
