data_1ROQ

_pdbx_vrpt_database.id    PDB
_pdbx_vrpt_database.code  1ROQ
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_pdbx_vrpt_exptl.ordinal  1
_pdbx_vrpt_exptl.method   nmr
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_pdbx_vrpt_summary.entry_id                    1ROQ
_pdbx_vrpt_summary.PDB_deposition_date         2003-12-02
_pdbx_vrpt_summary.PDB_revision_number         4
_pdbx_vrpt_summary.PDB_revision_date           2022-03-02
_pdbx_vrpt_summary.RNA_suiteness               0.62
_pdbx_vrpt_summary.report_creation_date        2022-02-19:21:34
_pdbx_vrpt_summary.attempted_validation_steps  molprobity,validation-pack,coreclust,chemicalshifts,percentiles,writepdf,writexml,writecif
_pdbx_vrpt_summary.ligands_for_buster_report   N
#
_pdbx_vrpt_entity.id           1
_pdbx_vrpt_entity.type         polymer
_pdbx_vrpt_entity.description  "5'-R(*GP*GP*UP*AP*UP*CP*AP*CP*GP*GP*UP*AP*CP*C)-3'"
#
_pdbx_vrpt_asym.label_asym_id  A
_pdbx_vrpt_asym.entity_id      1
#
loop_
_pdbx_vrpt_percentile_list.id
_pdbx_vrpt_percentile_list.range
_pdbx_vrpt_percentile_list.exp_method
1  all  pdb    
2  nmr  x-ray  
#
loop_
_pdbx_vrpt_percentile_type.id
_pdbx_vrpt_percentile_type.type
1  all_atom_clashscore   
2  RNAsuiteness_percent  
#
loop_
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.id
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.percentile_list_id
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.type_id
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.rank
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.number_entries_total
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.res_high
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.res_low
1  1  1  12.80  158937  ?     ?     
2  2  1  35.77   12864  ?     ?     
3  1  2  74.87    4643  ?     ?     
4  2  2  84.91     676  ?     ?     
#
loop_
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.ordinal
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.PDB_model_num
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.entity_id
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.label_asym_id
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.auth_asym_id
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.angles_RMSZ
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.bonds_RMSZ
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.num_bonds_RMSZ
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.num_angles_RMSZ
 1   1  1  A  A  0.65  0.14  329  511  
 2   2  1  A  A  0.65  0.14  329  511  
 3   3  1  A  A  0.65  0.15  329  511  
 4   4  1  A  A  0.65  0.15  329  511  
 5   5  1  A  A  0.64  0.15  329  511  
 6   6  1  A  A  0.65  0.15  329  511  
 7   7  1  A  A  0.64  0.15  329  511  
 8   8  1  A  A  0.65  0.15  329  511  
 9   9  1  A  A  0.65  0.15  329  511  
10  10  1  A  A  0.65  0.15  329  511  
#
_pdbx_vrpt_summary_geometry.ordinal                 1
_pdbx_vrpt_summary_geometry.clashscore              18.53
_pdbx_vrpt_summary_geometry.clashscore_full_length  18.53
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_pdbx_vrpt_summary_geometry.num_angles_RMSZ         5110
_pdbx_vrpt_summary_geometry.angles_RMSZ             0.65
#
loop_
_pdbx_vrpt_model_instance.id
_pdbx_vrpt_model_instance.PDB_model_num
_pdbx_vrpt_model_instance.entity_id
_pdbx_vrpt_model_instance.label_asym_id
_pdbx_vrpt_model_instance.label_seq_id
_pdbx_vrpt_model_instance.label_comp_id
_pdbx_vrpt_model_instance.auth_asym_id
_pdbx_vrpt_model_instance.auth_seq_id
_pdbx_vrpt_model_instance.label_alt_id
_pdbx_vrpt_model_instance.PDB_ins_code
_pdbx_vrpt_model_instance.count_clashes
  1   1  1  A   1  G  A   1  .  ?        ?  
  2   1  1  A   2  G  A   2  .  ?        ?  
  3   1  1  A   3  U  A   3  .  ?        ?  
  4   1  1  A   4  A  A   4  .  ?        ?  
  5   1  1  A   5  U  A   5  .  ?        4  
  6   1  1  A   6  C  A   6  .  ?        4  
  7   1  1  A   7  A  A   7  .  ?        2  
  8   1  1  A   8  C  A   8  .  ?        2  
  9   1  1  A   9  G  A   9  .  ?        2  
 10   1  1  A  10  G  A  10  .  ?        ?  
 11   1  1  A  11  U  A  11  .  ?        ?  
 12   1  1  A  12  A  A  12  .  ?        ?  
 13   1  1  A  13  C  A  13  .  ?        ?  
 14   1  1  A  14  C  A  14  .  ?        ?  
 15   2  1  A   1  G  A   1  .  ?        ?  
 16   2  1  A   2  G  A   2  .  ?        ?  
 17   2  1  A   3  U  A   3  .  ?        ?  
 18   2  1  A   4  A  A   4  .  ?        ?  
 19   2  1  A   5  U  A   5  .  ?        2  
 20   2  1  A   6  C  A   6  .  ?        4  
 21   2  1  A   7  A  A   7  .  ?        2  
 22   2  1  A   8  C  A   8  .  ?        2  
 23   2  1  A   9  G  A   9  .  ?        2  
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 27   2  1  A  13  C  A  13  .  ?        ?  
 28   2  1  A  14  C  A  14  .  ?        ?  
 29   3  1  A   1  G  A   1  .  ?        ?  
 30   3  1  A   2  G  A   2  .  ?        ?  
 31   3  1  A   3  U  A   3  .  ?        ?  
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 33   3  1  A   5  U  A   5  .  ?        3  
 34   3  1  A   6  C  A   6  .  ?        5  
 35   3  1  A   7  A  A   7  .  ?        4  
 36   3  1  A   8  C  A   8  .  ?        2  
 37   3  1  A   9  G  A   9  .  ?        3  
 38   3  1  A  10  G  A  10  .  ?        1  
 39   3  1  A  11  U  A  11  .  ?        ?  
 40   3  1  A  12  A  A  12  .  ?        ?  
 41   3  1  A  13  C  A  13  .  ?        ?  
 42   3  1  A  14  C  A  14  .  ?        ?  
 43   4  1  A   1  G  A   1  .  ?        ?  
 44   4  1  A   2  G  A   2  .  ?        ?  
 45   4  1  A   3  U  A   3  .  ?        ?  
 46   4  1  A   4  A  A   4  .  ?        ?  
 47   4  1  A   5  U  A   5  .  ?        ?  
 48   4  1  A   6  C  A   6  .  ?        2  
 49   4  1  A   7  A  A   7  .  ?        2  
 50   4  1  A   8  C  A   8  .  ?        2  
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 54   4  1  A  12  A  A  12  .  ?        ?  
 55   4  1  A  13  C  A  13  .  ?        ?  
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 57   5  1  A   1  G  A   1  .  ?        ?  
 58   5  1  A   2  G  A   2  .  ?        ?  
 59   5  1  A   3  U  A   3  .  ?        ?  
 60   5  1  A   4  A  A   4  .  ?        ?  
 61   5  1  A   5  U  A   5  .  ?        1  
 62   5  1  A   6  C  A   6  .  ?        3  
 63   5  1  A   7  A  A   7  .  ?        2  
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 65   5  1  A   9  G  A   9  .  ?        9  
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 67   5  1  A  11  U  A  11  .  ?        ?  
 68   5  1  A  12  A  A  12  .  ?        ?  
 69   5  1  A  13  C  A  13  .  ?        ?  
 70   5  1  A  14  C  A  14  .  ?        ?  
 71   6  1  A   1  G  A   1  .  ?        ?  
 72   6  1  A   2  G  A   2  .  ?        ?  
 73   6  1  A   3  U  A   3  .  ?        ?  
 74   6  1  A   4  A  A   4  .  ?        ?  
 75   6  1  A   5  U  A   5  .  ?        5  
 76   6  1  A   6  C  A   6  .  ?        4  
 77   6  1  A   7  A  A   7  .  ?        1  
 78   6  1  A   8  C  A   8  .  ?        2  
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 81   6  1  A  11  U  A  11  .  ?        ?  
 82   6  1  A  12  A  A  12  .  ?        ?  
 83   6  1  A  13  C  A  13  .  ?        ?  
 84   6  1  A  14  C  A  14  .  ?        ?  
 85   7  1  A   1  G  A   1  .  ?        ?  
 86   7  1  A   2  G  A   2  .  ?        ?  
 87   7  1  A   3  U  A   3  .  ?        ?  
 88   7  1  A   4  A  A   4  .  ?        ?  
 89   7  1  A   5  U  A   5  .  ?        2  
 90   7  1  A   6  C  A   6  .  ?        3  
 91   7  1  A   7  A  A   7  .  ?        1  
 92   7  1  A   8  C  A   8  .  ?        1  
 93   7  1  A   9  G  A   9  .  ?        2  
 94   7  1  A  10  G  A  10  .  ?        1  
 95   7  1  A  11  U  A  11  .  ?        ?  
 96   7  1  A  12  A  A  12  .  ?        ?  
 97   7  1  A  13  C  A  13  .  ?        ?  
 98   7  1  A  14  C  A  14  .  ?        ?  
 99   8  1  A   1  G  A   1  .  ?        ?  
100   8  1  A   2  G  A   2  .  ?        ?  
101   8  1  A   3  U  A   3  .  ?        ?  
102   8  1  A   4  A  A   4  .  ?        1  
103   8  1  A   5  U  A   5  .  ?        6  
104   8  1  A   6  C  A   6  .  ?        8  
105   8  1  A   7  A  A   7  .  ?        2  
106   8  1  A   8  C  A   8  .  ?        1  
107   8  1  A   9  G  A   9  .  ?        1  
108   8  1  A  10  G  A  10  .  ?        1  
109   8  1  A  11  U  A  11  .  ?        ?  
110   8  1  A  12  A  A  12  .  ?        ?  
111   8  1  A  13  C  A  13  .  ?        ?  
112   8  1  A  14  C  A  14  .  ?        ?  
113   9  1  A   1  G  A   1  .  ?        ?  
114   9  1  A   2  G  A   2  .  ?        ?  
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116   9  1  A   4  A  A   4  .  ?        ?  
117   9  1  A   5  U  A   5  .  ?        3  
118   9  1  A   6  C  A   6  .  ?        4  
119   9  1  A   7  A  A   7  .  ?        3  
120   9  1  A   8  C  A   8  .  ?        2  
121   9  1  A   9  G  A   9  .  ?        4  
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124   9  1  A  12  A  A  12  .  ?        ?  
125   9  1  A  13  C  A  13  .  ?        ?  
126   9  1  A  14  C  A  14  .  ?        ?  
127  10  1  A   1  G  A   1  .  ?        ?  
128  10  1  A   2  G  A   2  .  ?        ?  
129  10  1  A   3  U  A   3  .  ?        ?  
130  10  1  A   4  A  A   4  .  ?        ?  
131  10  1  A   5  U  A   5  .  ?        3  
132  10  1  A   6  C  A   6  .  ?        6  
133  10  1  A   7  A  A   7  .  ?        4  
134  10  1  A   8  C  A   8  .  ?        2  
135  10  1  A   9  G  A   9  .  ?        7  
136  10  1  A  10  G  A  10  .  ?        4  
137  10  1  A  11  U  A  11  .  ?        ?  
138  10  1  A  12  A  A  12  .  ?        ?  
139  10  1  A  13  C  A  13  .  ?        ?  
140  10  1  A  14  C  A  14  .  ?        ?  
#
loop_
_pdbx_vrpt_model_instance_geometry.ordinal
_pdbx_vrpt_model_instance_geometry.instance_id
_pdbx_vrpt_model_instance_geometry.RNA_score
_pdbx_vrpt_model_instance_geometry.RNA_suite
_pdbx_vrpt_model_instance_geometry.num_H_reduce
_pdbx_vrpt_model_instance_geometry.num_bonds_RMSZ
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_pdbx_vrpt_model_instance_geometry.angles_RMSZ
_pdbx_vrpt_model_instance_geometry.program_for_bond_angle_geometry
  1    1  0.00  NotAvailable       12  23  0.15  37  0.42  molprobity  
  2    2  0.92  Rotameric          11  26  0.15  41  0.63  molprobity  
  3    3  0.95  Rotameric          10  22  0.16  34  0.69  molprobity  
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  5    5  0.83  Rotameric          10  22  0.18  34  0.70  molprobity  
  6    6  0.00  NonRotameric       11  22  0.15  34  0.68  molprobity  
  7    7  0.15  Rotameric          11  25  0.10  39  0.66  molprobity  
  8    8  0.70  Rotameric          11  22  0.16  34  0.72  molprobity  
  9    9  0.00  Triaged/NotBinned  11  26  0.16  41  0.63  molprobity  
 10   10  0.00  NonRotameric       11  26  0.13  41  0.65  molprobity  
 11   11  0.73  Rotameric          10  22  0.15  34  0.70  molprobity  
 12   12  0.89  Rotameric          11  25  0.11  39  0.63  molprobity  
 13   13  0.91  Rotameric          11  22  0.15  34  0.68  molprobity  
 14   14  0.96  Rotameric          12  21  0.14  30  0.63  molprobity  
 15   15  0.00  NotAvailable       12  23  0.15  37  0.43  molprobity  
 16   16  0.93  Rotameric          11  26  0.13  41  0.64  molprobity  
 17   17  0.95  Rotameric          10  22  0.15  34  0.68  molprobity  
 18   18  0.92  Rotameric          11  25  0.13  39  0.63  molprobity  
 19   19  0.75  Rotameric          10  22  0.19  34  0.71  molprobity  
 20   20  0.00  NonRotameric       11  22  0.15  34  0.69  molprobity  
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 22   22  0.13  Rotameric          11  22  0.17  34  0.70  molprobity  
 23   23  0.00  NonRotameric       11  26  0.14  41  0.62  molprobity  
 24   24  0.53  Rotameric          11  26  0.12  41  0.64  molprobity  
 25   25  0.67  Rotameric          10  22  0.15  34  0.69  molprobity  
 26   26  0.87  Rotameric          11  25  0.11  39  0.62  molprobity  
 27   27  0.91  Rotameric          11  22  0.15  34  0.67  molprobity  
 28   28  0.95  Rotameric          12  21  0.16  30  0.62  molprobity  
 29   29  0.00  NotAvailable       12  23  0.14  37  0.43  molprobity  
 30   30  0.92  Rotameric          11  26  0.14  41  0.63  molprobity  
 31   31  0.95  Rotameric          10  22  0.16  34  0.68  molprobity  
 32   32  0.85  Rotameric          11  25  0.13  39  0.63  molprobity  
 33   33  0.66  Rotameric          10  22  0.22  34  0.70  molprobity  
 34   34  0.04  Rotameric          11  22  0.15  34  0.69  molprobity  
 35   35  0.01  Rotameric          11  25  0.12  39  0.68  molprobity  
 36   36  0.00  NonRotameric       11  22  0.20  34  0.70  molprobity  
 37   37  0.00  Triaged/NotBinned  11  26  0.14  41  0.62  molprobity  
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 40   40  0.85  Rotameric          11  25  0.11  39  0.63  molprobity  
 41   41  0.90  Rotameric          11  22  0.15  34  0.67  molprobity  
 42   42  0.96  Rotameric          12  21  0.15  30  0.62  molprobity  
 43   43  0.00  NotAvailable       12  23  0.14  37  0.42  molprobity  
 44   44  0.92  Rotameric          11  26  0.14  41  0.64  molprobity  
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 10    7  C8       5  0.44  2.70  
 11    8  "H4'"    6  0.58  1.98  
 12    8  "O4'"    7  0.41  2.74  
 13    9  "O4'"    6  0.58  1.98  
 14    9  C2       7  0.41  2.74  
 15   19  C4       8  0.56  2.93  
 16   19  "C2'"    9  0.42  2.67  
 17   20  C4       8  0.56  2.93  
 18   20  "O2'"   10  0.45  2.69  
 19   20  "O2'"   11  0.44  1.95  
 20   20  "O5'"    9  0.42  2.67  
 21   21  C8      10  0.45  2.69  
 22   21  H8      11  0.44  1.95  
 23   22  "H4'"   12  0.51  2.05  
 24   22  "O4'"   13  0.44  2.71  
 25   23  "O4'"   12  0.51  2.05  
 26   23  C2      13  0.44  2.71  
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 44   38  C6      19  0.47  2.67  
 45   48  "O2'"   23  0.62  1.76  
 46   48  "O2'"   24  0.47  2.64  
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 48   49  C8      24  0.47  2.64  
 49   50  "H4'"   25  0.53  2.03  
 50   50  "O4'"   26  0.45  2.70  
 51   51  "O4'"   25  0.53  2.03  
 52   51  C2      26  0.45  2.70  
 53   51  C2      27  0.42  3.07  
 54   52  C8      27  0.42  3.07  
 55   61  C4      28  0.57  2.92  
 56   62  C4      28  0.57  2.92  
 57   62  "O2'"   29  0.48  2.66  
 58   62  "O2'"   30  0.48  1.91  
 59   63  C8      29  0.48  2.66  
 60   63  H8      30  0.48  1.91  
 61   64  "H4'"   31  0.74  1.83  
 62   64  "O4'"   32  0.45  2.69  
 63   65  "O4'"   31  0.74  1.83  
 64   65  C2      33  0.50  2.79  
 65   65  C2      34  0.47  3.02  
 66   65  C2      32  0.45  2.69  
 67   65  N2      35  0.49  2.61  
 68   65  "C4'"   36  0.42  2.67  
 69   65  OP1     36  0.42  2.67  
 70   65  "C2'"   37  0.42  2.68  
 71   65  "H2'"   38  0.41  2.16  
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 76   66  OP1     38  0.41  2.16  
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 86   77  C8      43  0.45  2.70  
 87   78  "H4'"   44  0.58  1.98  
 88   78  "O4'"   45  0.44  2.70  
 89   79  "O4'"   44  0.58  1.98  
 90   79  C2      46  0.53  2.97  
 91   79  C2      45  0.44  2.70  
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100   91  H8      50  0.43  1.97  
101   92  "O4'"   51  0.44  2.70  
102   93  C2      52  0.49  3.00  
103   93  C2      51  0.44  2.70  
104   94  C8      52  0.49  3.00  
105  102  "O2'"   53  0.44  2.12  
106  103  C4      54  0.56  2.94  
107  103  C4      55  0.42  2.87  
108  103  N3      56  0.55  2.55  
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111  103  "C2'"   58  0.43  2.65  
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113  104  N3      56  0.55  2.55  
114  104  "O2'"   59  0.49  2.66  
115  104  O2      60  0.48  2.66  
116  104  "HO2'"  61  0.48  1.51  
117  104  C2      57  0.46  3.03  
118  104  "O5'"   58  0.43  2.65  
119  104  N4      55  0.42  2.87  
120  105  C8      59  0.49  2.66  
121  105  H8      61  0.48  1.51  
122  106  "H4'"   62  0.50  2.06  
123  107  "O4'"   62  0.50  2.06  
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133  119  H8      66  0.52  1.86  
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135  120  "O4'"   68  0.46  2.68  
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#
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2  percentiles  "20191225.v01 (using entries in the PDB archive December 25th 2019)"  N  
##
