data_1MFJ

_pdbx_vrpt_database.id    PDB
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_pdbx_vrpt_entity.id           1
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1  all  pdb    
2  nmr  x-ray  
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1  all_atom_clashscore   
2  RNAsuiteness_percent  
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1  1  1   99.94  158937  ?     ?     
2  2  1  100.00   12864  ?     ?     
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4  2  2   80.77     676  ?     ?     
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_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.ordinal
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.PDB_model_num
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.entity_id
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_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.auth_asym_id
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 1   1  1  A  A  1.08  0.73  475  739  
 2   2  1  A  A  1.10  0.74  475  739  
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_pdbx_vrpt_summary_geometry.ordinal                 1
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_pdbx_vrpt_summary_geometry.angles_RMSZ             1.10
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loop_
_pdbx_vrpt_model_instance.id
_pdbx_vrpt_model_instance.PDB_model_num
_pdbx_vrpt_model_instance.entity_id
_pdbx_vrpt_model_instance.label_asym_id
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_pdbx_vrpt_model_instance.PDB_ins_code
_pdbx_vrpt_model_instance.count_angle_outliers
  1   1  1  A   1  G  A   1  .  ?        ?  
  2   1  1  A   2  A  A   2  .  ?        ?  
  3   1  1  A   3  C  A   3  .  ?        ?  
  4   1  1  A   4  A  A   4  .  ?        ?  
  5   1  1  A   5  G  A   5  .  ?        ?  
  6   1  1  A   6  U  A   6  .  ?        ?  
  7   1  1  A   7  C  A   7  .  ?        ?  
  8   1  1  A   8  U  A   8  .  ?        ?  
  9   1  1  A   9  C  A   9  .  ?        ?  
 10   1  1  A  10  U  A  10  .  ?        ?  
 11   1  1  A  11  A  A  11  .  ?        ?  
 12   1  1  A  12  C  A  12  .  ?        ?  
 13   1  1  A  13  G  A  13  .  ?        ?  
 14   1  1  A  14  G  A  14  .  ?        ?  
 15   1  1  A  15  A  A  15  .  ?        ?  
 16   1  1  A  16  G  A  16  .  ?        ?  
 17   1  1  A  17  A  A  17  .  ?        ?  
 18   1  1  A  18  C  A  18  .  ?        ?  
 19   1  1  A  19  U  A  19  .  ?        ?  
 20   1  1  A  20  G  A  20  .  ?        ?  
 21   2  1  A   1  G  A   1  .  ?        ?  
 22   2  1  A   2  A  A   2  .  ?        ?  
 23   2  1  A   3  C  A   3  .  ?        ?  
 24   2  1  A   4  A  A   4  .  ?        ?  
 25   2  1  A   5  G  A   5  .  ?        ?  
 26   2  1  A   6  U  A   6  .  ?        ?  
 27   2  1  A   7  C  A   7  .  ?        ?  
 28   2  1  A   8  U  A   8  .  ?        ?  
 29   2  1  A   9  C  A   9  .  ?        ?  
 30   2  1  A  10  U  A  10  .  ?        ?  
 31   2  1  A  11  A  A  11  .  ?        ?  
 32   2  1  A  12  C  A  12  .  ?        ?  
 33   2  1  A  13  G  A  13  .  ?        ?  
 34   2  1  A  14  G  A  14  .  ?        ?  
 35   2  1  A  15  A  A  15  .  ?        ?  
 36   2  1  A  16  G  A  16  .  ?        ?  
 37   2  1  A  17  A  A  17  .  ?        ?  
 38   2  1  A  18  C  A  18  .  ?        ?  
 39   2  1  A  19  U  A  19  .  ?        ?  
 40   2  1  A  20  G  A  20  .  ?        ?  
 41   3  1  A   1  G  A   1  .  ?        ?  
 42   3  1  A   2  A  A   2  .  ?        ?  
 43   3  1  A   3  C  A   3  .  ?        ?  
 44   3  1  A   4  A  A   4  .  ?        ?  
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 48   3  1  A   8  U  A   8  .  ?        ?  
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 52   3  1  A  12  C  A  12  .  ?        ?  
 53   3  1  A  13  G  A  13  .  ?        1  
 54   3  1  A  14  G  A  14  .  ?        ?  
 55   3  1  A  15  A  A  15  .  ?        ?  
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 58   3  1  A  18  C  A  18  .  ?        ?  
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 60   3  1  A  20  G  A  20  .  ?        ?  
 61   4  1  A   1  G  A   1  .  ?        ?  
 62   4  1  A   2  A  A   2  .  ?        ?  
 63   4  1  A   3  C  A   3  .  ?        ?  
 64   4  1  A   4  A  A   4  .  ?        ?  
 65   4  1  A   5  G  A   5  .  ?        ?  
 66   4  1  A   6  U  A   6  .  ?        ?  
 67   4  1  A   7  C  A   7  .  ?        ?  
 68   4  1  A   8  U  A   8  .  ?        ?  
 69   4  1  A   9  C  A   9  .  ?        ?  
 70   4  1  A  10  U  A  10  .  ?        ?  
 71   4  1  A  11  A  A  11  .  ?        ?  
 72   4  1  A  12  C  A  12  .  ?        ?  
 73   4  1  A  13  G  A  13  .  ?        ?  
 74   4  1  A  14  G  A  14  .  ?        ?  
 75   4  1  A  15  A  A  15  .  ?        ?  
 76   4  1  A  16  G  A  16  .  ?        ?  
 77   4  1  A  17  A  A  17  .  ?        ?  
 78   4  1  A  18  C  A  18  .  ?        ?  
 79   4  1  A  19  U  A  19  .  ?        ?  
 80   4  1  A  20  G  A  20  .  ?        ?  
 81   5  1  A   1  G  A   1  .  ?        ?  
 82   5  1  A   2  A  A   2  .  ?        ?  
 83   5  1  A   3  C  A   3  .  ?        ?  
 84   5  1  A   4  A  A   4  .  ?        ?  
 85   5  1  A   5  G  A   5  .  ?        ?  
 86   5  1  A   6  U  A   6  .  ?        ?  
 87   5  1  A   7  C  A   7  .  ?        ?  
 88   5  1  A   8  U  A   8  .  ?        ?  
 89   5  1  A   9  C  A   9  .  ?        ?  
 90   5  1  A  10  U  A  10  .  ?        ?  
 91   5  1  A  11  A  A  11  .  ?        ?  
 92   5  1  A  12  C  A  12  .  ?        ?  
 93   5  1  A  13  G  A  13  .  ?        ?  
 94   5  1  A  14  G  A  14  .  ?        ?  
 95   5  1  A  15  A  A  15  .  ?        ?  
 96   5  1  A  16  G  A  16  .  ?        ?  
 97   5  1  A  17  A  A  17  .  ?        ?  
 98   5  1  A  18  C  A  18  .  ?        ?  
 99   5  1  A  19  U  A  19  .  ?        ?  
100   5  1  A  20  G  A  20  .  ?        ?  
101   6  1  A   1  G  A   1  .  ?        ?  
102   6  1  A   2  A  A   2  .  ?        ?  
103   6  1  A   3  C  A   3  .  ?        ?  
104   6  1  A   4  A  A   4  .  ?        ?  
105   6  1  A   5  G  A   5  .  ?        ?  
106   6  1  A   6  U  A   6  .  ?        ?  
107   6  1  A   7  C  A   7  .  ?        ?  
108   6  1  A   8  U  A   8  .  ?        ?  
109   6  1  A   9  C  A   9  .  ?        ?  
110   6  1  A  10  U  A  10  .  ?        ?  
111   6  1  A  11  A  A  11  .  ?        ?  
112   6  1  A  12  C  A  12  .  ?        ?  
113   6  1  A  13  G  A  13  .  ?        ?  
114   6  1  A  14  G  A  14  .  ?        ?  
115   6  1  A  15  A  A  15  .  ?        ?  
116   6  1  A  16  G  A  16  .  ?        ?  
117   6  1  A  17  A  A  17  .  ?        ?  
118   6  1  A  18  C  A  18  .  ?        ?  
119   6  1  A  19  U  A  19  .  ?        ?  
120   6  1  A  20  G  A  20  .  ?        ?  
121   7  1  A   1  G  A   1  .  ?        ?  
122   7  1  A   2  A  A   2  .  ?        ?  
123   7  1  A   3  C  A   3  .  ?        ?  
124   7  1  A   4  A  A   4  .  ?        ?  
125   7  1  A   5  G  A   5  .  ?        ?  
126   7  1  A   6  U  A   6  .  ?        ?  
127   7  1  A   7  C  A   7  .  ?        ?  
128   7  1  A   8  U  A   8  .  ?        ?  
129   7  1  A   9  C  A   9  .  ?        ?  
130   7  1  A  10  U  A  10  .  ?        ?  
131   7  1  A  11  A  A  11  .  ?        ?  
132   7  1  A  12  C  A  12  .  ?        ?  
133   7  1  A  13  G  A  13  .  ?        ?  
134   7  1  A  14  G  A  14  .  ?        ?  
135   7  1  A  15  A  A  15  .  ?        1  
136   7  1  A  16  G  A  16  .  ?        ?  
137   7  1  A  17  A  A  17  .  ?        ?  
138   7  1  A  18  C  A  18  .  ?        ?  
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140   7  1  A  20  G  A  20  .  ?        ?  
141   8  1  A   1  G  A   1  .  ?        ?  
142   8  1  A   2  A  A   2  .  ?        ?  
143   8  1  A   3  C  A   3  .  ?        ?  
144   8  1  A   4  A  A   4  .  ?        ?  
145   8  1  A   5  G  A   5  .  ?        ?  
146   8  1  A   6  U  A   6  .  ?        ?  
147   8  1  A   7  C  A   7  .  ?        ?  
148   8  1  A   8  U  A   8  .  ?        ?  
149   8  1  A   9  C  A   9  .  ?        ?  
150   8  1  A  10  U  A  10  .  ?        ?  
151   8  1  A  11  A  A  11  .  ?        ?  
152   8  1  A  12  C  A  12  .  ?        ?  
153   8  1  A  13  G  A  13  .  ?        ?  
154   8  1  A  14  G  A  14  .  ?        ?  
155   8  1  A  15  A  A  15  .  ?        ?  
156   8  1  A  16  G  A  16  .  ?        ?  
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 94   94  0.01  Rotameric          ?        11  26  0.69  41  1.14  molprobity  
 95   95  0.57  Rotameric          ?        11  25  0.85  39  0.95  molprobity  
 96   96  0.78  Rotameric          ?        11  26  0.68  41  1.15  molprobity  
 97   97  0.71  Rotameric          ?        11  25  0.82  39  0.99  molprobity  
 98   98  0.57  Rotameric          ?        11  22  0.75  34  1.05  molprobity  
 99   99  0.67  Rotameric          ?        10  22  0.58  34  1.22  molprobity  
100  100  0.38  Rotameric          ?        12  25  0.66  37  1.11  molprobity  
101  101  0.00  NotAvailable       ?        12  23  0.67  37  0.99  molprobity  
102  102  0.46  Rotameric          ?        11  25  0.89  39  0.96  molprobity  
103  103  0.71  Rotameric          ?        11  22  0.76  34  1.25  molprobity  
104  104  0.58  Rotameric          ?        11  25  0.88  39  0.95  molprobity  
105  105  0.79  Rotameric          ?        11  26  0.68  41  1.15  molprobity  
106  106  0.79  Rotameric          ?        10  22  0.55  34  1.13  molprobity  
107  107  0.78  Rotameric          ?        11  22  0.76  34  1.02  molprobity  
108  108  0.71  Rotameric          ?        10  22  0.58  34  1.19  molprobity  
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110  110  0.61  Rotameric          ?        10  22  0.55  34  1.16  molprobity  
111  111  0.44  Rotameric          ?        11  25  0.87  39  0.88  molprobity  
112  112  0.45  Rotameric          ?        11  22  0.76  34  0.88  molprobity  
113  113  0.49  Rotameric          ?        11  26  0.67  41  1.32  molprobity  
114  114  0.01  Rotameric          ?        11  26  0.68  41  1.12  molprobity  
115  115  0.52  Rotameric          ?        11  25  0.84  39  0.95  molprobity  
116  116  0.74  Rotameric          ?        11  26  0.67  41  1.17  molprobity  
117  117  0.73  Rotameric          ?        11  25  0.86  39  1.00  molprobity  
118  118  0.57  Rotameric          ?        11  22  0.74  34  1.05  molprobity  
119  119  0.69  Rotameric          ?        10  22  0.58  34  1.27  molprobity  
120  120  0.65  Rotameric          ?        12  25  0.70  37  1.22  molprobity  
121  121  0.00  NotAvailable       ?        12  23  0.70  37  1.01  molprobity  
122  122  0.34  Rotameric          ?        11  25  0.84  39  1.01  molprobity  
123  123  0.72  Rotameric          ?        11  22  0.75  34  1.01  molprobity  
124  124  0.63  Rotameric          ?        11  25  0.87  39  0.94  molprobity  
125  125  0.70  Rotameric          ?        11  26  0.67  41  1.15  molprobity  
126  126  0.78  Rotameric          ?        10  22  0.55  34  1.15  molprobity  
127  127  0.70  Rotameric          ?        11  22  0.75  34  1.04  molprobity  
128  128  0.68  Rotameric          ?        10  22  0.56  34  1.17  molprobity  
129  129  0.73  Rotameric          ?        11  22  0.76  34  1.01  molprobity  
130  130  0.70  Rotameric          ?        10  22  0.54  34  1.16  molprobity  
131  131  0.16  Rotameric          ?        11  25  0.87  39  0.96  molprobity  
132  132  0.26  Rotameric          ?        11  22  0.73  34  0.86  molprobity  
133  133  0.67  Rotameric          ?        11  26  0.70  41  1.20  molprobity  
134  134  0.07  Rotameric          ?        11  26  0.65  41  1.14  molprobity  
135  135  0.16  Rotameric          outlier  11  25  0.93  39  1.72  molprobity  
136  136  0.03  Rotameric          ?        11  26  0.66  41  1.14  molprobity  
137  137  0.66  Rotameric          ?        11  25  0.88  39  0.96  molprobity  
138  138  0.72  Rotameric          ?        11  22  0.73  34  1.01  molprobity  
139  139  0.80  Rotameric          ?        10  22  0.54  34  1.17  molprobity  
140  140  0.75  Rotameric          ?        12  25  0.69  37  1.17  molprobity  
141  141  0.00  NotAvailable       outlier  12  23  0.74  37  1.21  molprobity  
142  142  0.01  Rotameric          ?        11  25  0.85  39  0.97  molprobity  
143  143  0.60  Rotameric          ?        11  22  0.76  34  1.02  molprobity  
144  144  0.80  Rotameric          ?        11  25  0.90  39  0.98  molprobity  
145  145  0.69  Rotameric          ?        11  26  0.65  41  1.15  molprobity  
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147  147  0.63  Rotameric          ?        11  22  0.75  34  1.08  molprobity  
148  148  0.73  Rotameric          ?        10  22  0.57  34  1.18  molprobity  
149  149  0.73  Rotameric          ?        11  22  0.75  34  1.09  molprobity  
150  150  0.60  Rotameric          ?        10  22  0.53  34  1.15  molprobity  
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153  153  0.65  Rotameric          ?        11  26  0.69  41  1.29  molprobity  
154  154  0.00  NonRotameric       ?        11  26  0.66  41  1.15  molprobity  
155  155  0.61  Rotameric          ?        11  25  0.87  39  1.01  molprobity  
156  156  0.61  Rotameric          ?        11  26  0.69  41  1.20  molprobity  
157  157  0.65  Rotameric          ?        11  25  0.86  39  1.00  molprobity  
158  158  0.61  Rotameric          ?        11  22  0.74  34  1.05  molprobity  
159  159  0.72  Rotameric          ?        10  22  0.55  34  1.19  molprobity  
160  160  0.73  Rotameric          ?        12  25  0.69  37  1.24  molprobity  
161  161  0.00  NotAvailable       outlier  12  23  0.72  37  1.41  molprobity  
162  162  0.21  Rotameric          ?        11  25  0.87  39  1.03  molprobity  
163  163  0.80  Rotameric          ?        11  22  0.76  34  1.02  molprobity  
164  164  0.74  Rotameric          ?        11  25  0.85  39  0.95  molprobity  
165  165  0.69  Rotameric          ?        11  26  0.68  41  1.18  molprobity  
166  166  0.75  Rotameric          ?        10  22  0.56  34  1.16  molprobity  
167  167  0.69  Rotameric          ?        11  22  0.75  34  1.06  molprobity  
168  168  0.72  Rotameric          ?        10  22  0.57  34  1.18  molprobity  
169  169  0.34  Rotameric          ?        11  22  0.76  34  1.23  molprobity  
170  170  0.51  Rotameric          ?        10  22  0.58  34  1.17  molprobity  
171  171  0.47  Rotameric          ?        11  25  0.86  39  0.86  molprobity  
172  172  0.59  Rotameric          ?        11  22  0.78  34  0.89  molprobity  
173  173  0.70  Rotameric          ?        11  26  0.68  41  1.36  molprobity  
174  174  0.12  Rotameric          ?        11  26  0.67  41  1.14  molprobity  
175  175  0.62  Rotameric          ?        11  25  0.86  39  0.97  molprobity  
176  176  0.61  Rotameric          ?        11  26  0.67  41  1.16  molprobity  
177  177  0.57  Rotameric          ?        11  25  0.86  39  0.98  molprobity  
178  178  0.60  Rotameric          ?        11  22  0.74  34  1.05  molprobity  
179  179  0.70  Rotameric          ?        10  22  0.55  34  1.21  molprobity  
180  180  0.77  Rotameric          ?        12  25  0.68  37  1.23  molprobity  
181  181  0.00  NotAvailable       outlier  12  23  0.70  37  1.12  molprobity  
182  182  0.18  Rotameric          ?        11  25  0.85  39  0.99  molprobity  
183  183  0.80  Rotameric          ?        11  22  0.75  34  0.99  molprobity  
184  184  0.65  Rotameric          ?        11  25  0.89  39  0.97  molprobity  
185  185  0.63  Rotameric          ?        11  26  0.66  41  1.15  molprobity  
186  186  0.74  Rotameric          ?        10  22  0.56  34  1.16  molprobity  
187  187  0.70  Rotameric          ?        11  22  0.76  34  1.04  molprobity  
188  188  0.74  Rotameric          ?        10  22  0.56  34  1.18  molprobity  
189  189  0.56  Rotameric          ?        11  22  0.76  34  1.03  molprobity  
190  190  0.60  Rotameric          ?        10  22  0.55  34  1.16  molprobity  
191  191  0.47  Rotameric          ?        11  25  0.87  39  0.84  molprobity  
192  192  0.72  Rotameric          ?        11  22  0.75  34  0.91  molprobity  
193  193  0.00  Triaged/NotBinned  ?        11  26  0.71  41  1.22  molprobity  
194  194  0.15  Rotameric          ?        11  26  0.64  41  1.14  molprobity  
195  195  0.68  Rotameric          ?        11  25  0.88  39  0.96  molprobity  
196  196  0.60  Rotameric          ?        11  26  0.68  41  1.17  molprobity  
197  197  0.51  Rotameric          ?        11  25  0.86  39  0.99  molprobity  
198  198  0.64  Rotameric          ?        11  22  0.74  34  1.03  molprobity  
199  199  0.74  Rotameric          ?        10  22  0.54  34  1.20  molprobity  
200  200  0.75  Rotameric          ?        12  25  0.68  37  1.19  molprobity  
#
loop_
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_pdbx_vrpt_instance_intra_angle_outliers.Z
1   53  "C3'"  "C2'"  "C1'"  105.529  101.500  0.800  5.04  
2  135  "C3'"  "C2'"  "C1'"  107.113  101.500  0.800  7.02  
3  173  "C3'"  "C2'"  "C1'"  105.526  101.500  0.800  5.03  
#
loop_
_pdbx_vrpt_software.ordinal
_pdbx_vrpt_software.name
_pdbx_vrpt_software.version
_pdbx_vrpt_software.success_y_or_n
1  molprobity   4.02b-467                                                             Y  
2  percentiles  "20191225.v01 (using entries in the PDB archive December 25th 2019)"  N  
##
