data_1JVE

_pdbx_vrpt_database.id    PDB
_pdbx_vrpt_database.code  1JVE
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_pdbx_vrpt_exptl.ordinal  1
_pdbx_vrpt_exptl.method   nmr
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_pdbx_vrpt_summary.entry_id                    1JVE
_pdbx_vrpt_summary.PDB_deposition_date         2001-08-29
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_pdbx_vrpt_summary.PDB_revision_date           2022-02-23
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_pdbx_vrpt_summary.attempted_validation_steps  molprobity,validation-pack,coreclust,chemicalshifts,percentiles,writepdf,writexml,writecif
_pdbx_vrpt_summary.ligands_for_buster_report   N
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_pdbx_vrpt_entity.type         polymer
_pdbx_vrpt_entity.description  "AT-Rich DNA with the GAA-Hairpin Loop"
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_pdbx_vrpt_asym.label_asym_id  A
_pdbx_vrpt_asym.entity_id      1
#
loop_
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_pdbx_vrpt_percentile_list.range
_pdbx_vrpt_percentile_list.exp_method
1  all  pdb    
2  nmr  x-ray  
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_pdbx_vrpt_percentile_type.id    1
_pdbx_vrpt_percentile_type.type  all_atom_clashscore
#
loop_
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_pdbx_vrpt_percentile_conditions.type_id
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.rank
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_pdbx_vrpt_percentile_conditions.res_low
1  1  1  85.83  158937  ?     ?     
2  2  1  77.22   12864  ?     ?     
#
loop_
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.ordinal
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.PDB_model_num
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.entity_id
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.label_asym_id
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.auth_asym_id
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.angles_RMSZ
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.bonds_RMSZ
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.num_bonds_RMSZ
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.num_angles_RMSZ
 1   1  1  A  A  1.19  0.79  621  957  
 2   2  1  A  A  1.17  0.79  621  957  
 3   3  1  A  A  1.19  0.79  621  957  
 4   4  1  A  A  1.19  0.79  621  957  
 5   5  1  A  A  1.20  0.79  621  957  
 6   6  1  A  A  1.20  0.79  621  957  
 7   7  1  A  A  1.19  0.79  621  957  
 8   8  1  A  A  1.20  0.79  621  957  
 9   9  1  A  A  1.19  0.79  621  957  
10  10  1  A  A  1.19  0.79  621  957  
#
_pdbx_vrpt_summary_geometry.ordinal                 1
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_pdbx_vrpt_summary_geometry.angles_RMSZ             1.19
#
loop_
_pdbx_vrpt_model_instance.id
_pdbx_vrpt_model_instance.PDB_model_num
_pdbx_vrpt_model_instance.entity_id
_pdbx_vrpt_model_instance.label_asym_id
_pdbx_vrpt_model_instance.label_seq_id
_pdbx_vrpt_model_instance.label_comp_id
_pdbx_vrpt_model_instance.auth_asym_id
_pdbx_vrpt_model_instance.auth_seq_id
_pdbx_vrpt_model_instance.label_alt_id
_pdbx_vrpt_model_instance.PDB_ins_code
_pdbx_vrpt_model_instance.count_angle_outliers
_pdbx_vrpt_model_instance.count_clashes
  1   1  1  A   1  DC  A   1  .  ?        ?     ?  
  2   1  1  A   2  DC  A   2  .  ?        ?     ?  
  3   1  1  A   3  DT  A   3  .  ?        ?     ?  
  4   1  1  A   4  DA  A   4  .  ?        ?     ?  
  5   1  1  A   5  DA  A   5  .  ?        ?     ?  
  6   1  1  A   6  DT  A   6  .  ?        ?     ?  
  7   1  1  A   7  DT  A   7  .  ?        ?     ?  
  8   1  1  A   8  DA  A   8  .  ?        ?     1  
  9   1  1  A   9  DT  A   9  .  ?        ?     ?  
 10   1  1  A  10  DA  A  10  .  ?        ?     1  
 11   1  1  A  11  DA  A  11  .  ?        ?     ?  
 12   1  1  A  12  DC  A  12  .  ?        ?     ?  
 13   1  1  A  13  DG  A  13  .  ?        ?     ?  
 14   1  1  A  14  DA  A  14  .  ?        ?     ?  
 15   1  1  A  15  DA  A  15  .  ?        ?     ?  
 16   1  1  A  16  DG  A  16  .  ?        ?     ?  
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 19   1  1  A  19  DA  A  19  .  ?        ?     1  
 20   1  1  A  20  DT  A  20  .  ?        ?     ?  
 21   1  1  A  21  DA  A  21  .  ?        ?     1  
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 27   1  1  A  27  DG  A  27  .  ?        ?     ?  
 28   2  1  A   1  DC  A   1  .  ?        ?     ?  
 29   2  1  A   2  DC  A   2  .  ?        ?     ?  
 30   2  1  A   3  DT  A   3  .  ?        ?     ?  
 31   2  1  A   4  DA  A   4  .  ?        ?     ?  
 32   2  1  A   5  DA  A   5  .  ?        ?     ?  
 33   2  1  A   6  DT  A   6  .  ?        ?     ?  
 34   2  1  A   7  DT  A   7  .  ?        ?     ?  
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 37   2  1  A  10  DA  A  10  .  ?        ?     1  
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 40   2  1  A  13  DG  A  13  .  ?        ?     ?  
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 54   2  1  A  27  DG  A  27  .  ?        ?     ?  
 55   3  1  A   1  DC  A   1  .  ?        ?     ?  
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 57   3  1  A   3  DT  A   3  .  ?        ?     ?  
 58   3  1  A   4  DA  A   4  .  ?        ?     ?  
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 62   3  1  A   8  DA  A   8  .  ?        ?     ?  
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 64   3  1  A  10  DA  A  10  .  ?        ?     1  
 65   3  1  A  11  DA  A  11  .  ?        ?     ?  
 66   3  1  A  12  DC  A  12  .  ?        ?     ?  
 67   3  1  A  13  DG  A  13  .  ?        ?     ?  
 68   3  1  A  14  DA  A  14  .  ?        ?     ?  
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 70   3  1  A  16  DG  A  16  .  ?        ?     ?  
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 73   3  1  A  19  DA  A  19  .  ?        ?     1  
 74   3  1  A  20  DT  A  20  .  ?        ?     ?  
 75   3  1  A  21  DA  A  21  .  ?        ?     ?  
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 78   3  1  A  24  DT  A  24  .  ?        ?     ?  
 79   3  1  A  25  DA  A  25  .  ?        ?     ?  
 80   3  1  A  26  DG  A  26  .  ?        ?     ?  
 81   3  1  A  27  DG  A  27  .  ?        ?     ?  
 82   4  1  A   1  DC  A   1  .  ?        ?     ?  
 83   4  1  A   2  DC  A   2  .  ?        ?     ?  
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 85   4  1  A   4  DA  A   4  .  ?        ?     1  
 86   4  1  A   5  DA  A   5  .  ?        ?     ?  
 87   4  1  A   6  DT  A   6  .  ?        ?     ?  
 88   4  1  A   7  DT  A   7  .  ?        ?     ?  
 89   4  1  A   8  DA  A   8  .  ?        ?     1  
 90   4  1  A   9  DT  A   9  .  ?        ?     ?  
 91   4  1  A  10  DA  A  10  .  ?        ?     1  
 92   4  1  A  11  DA  A  11  .  ?        ?     ?  
 93   4  1  A  12  DC  A  12  .  ?        ?     ?  
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 95   4  1  A  14  DA  A  14  .  ?        ?     ?  
 96   4  1  A  15  DA  A  15  .  ?        ?     ?  
 97   4  1  A  16  DG  A  16  .  ?        ?     ?  
 98   4  1  A  17  DT  A  17  .  ?        ?     ?  
 99   4  1  A  18  DT  A  18  .  ?        ?     ?  
100   4  1  A  19  DA  A  19  .  ?        ?     1  
101   4  1  A  20  DT  A  20  .  ?        ?     ?  
102   4  1  A  21  DA  A  21  .  ?        ?     1  
103   4  1  A  22  DA  A  22  .  ?        ?     ?  
104   4  1  A  23  DT  A  23  .  ?        ?     ?  
105   4  1  A  24  DT  A  24  .  ?        ?     ?  
106   4  1  A  25  DA  A  25  .  ?        ?     1  
107   4  1  A  26  DG  A  26  .  ?        ?     ?  
108   4  1  A  27  DG  A  27  .  ?        ?     ?  
109   5  1  A   1  DC  A   1  .  ?        ?     ?  
110   5  1  A   2  DC  A   2  .  ?        ?     ?  
111   5  1  A   3  DT  A   3  .  ?        ?     ?  
112   5  1  A   4  DA  A   4  .  ?        ?     1  
113   5  1  A   5  DA  A   5  .  ?        ?     ?  
114   5  1  A   6  DT  A   6  .  ?        ?     ?  
115   5  1  A   7  DT  A   7  .  ?        ?     ?  
116   5  1  A   8  DA  A   8  .  ?        ?     ?  
117   5  1  A   9  DT  A   9  .  ?        ?     ?  
118   5  1  A  10  DA  A  10  .  ?        ?     1  
119   5  1  A  11  DA  A  11  .  ?        ?     ?  
120   5  1  A  12  DC  A  12  .  ?        ?     ?  
121   5  1  A  13  DG  A  13  .  ?        ?     ?  
122   5  1  A  14  DA  A  14  .  ?        ?     ?  
123   5  1  A  15  DA  A  15  .  ?        ?     ?  
124   5  1  A  16  DG  A  16  .  ?        ?     ?  
125   5  1  A  17  DT  A  17  .  ?        ?     ?  
126   5  1  A  18  DT  A  18  .  ?        ?     ?  
127   5  1  A  19  DA  A  19  .  ?        ?     1  
128   5  1  A  20  DT  A  20  .  ?        ?     ?  
129   5  1  A  21  DA  A  21  .  ?        ?     ?  
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131   5  1  A  23  DT  A  23  .  ?        ?     ?  
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136   6  1  A   1  DC  A   1  .  ?        ?     ?  
137   6  1  A   2  DC  A   2  .  ?        ?     ?  
138   6  1  A   3  DT  A   3  .  ?        ?     ?  
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#
loop_
_pdbx_vrpt_instance_clashes.ordinal
_pdbx_vrpt_instance_clashes.instance_id
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 1    8  C2   1  0.42  3.08  
 2   10  C2   2  0.43  3.06  
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23  154  C2  12  0.44  3.05  
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#
_pdbx_vrpt_instance_intra_angle_outliers.ordinal      1
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_pdbx_vrpt_instance_intra_angle_outliers.atom_1       "O4'"
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#
loop_
_pdbx_vrpt_software.ordinal
_pdbx_vrpt_software.name
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_pdbx_vrpt_software.success_y_or_n
1  molprobity   4.02b-467                                                             Y  
2  percentiles  "20191225.v01 (using entries in the PDB archive December 25th 2019)"  N  
##
