data_1IOT

_pdbx_vrpt_database.id    PDB
_pdbx_vrpt_database.code  1IOT
#
_pdbx_vrpt_exptl.ordinal  1
_pdbx_vrpt_exptl.method   x-ray
#
_pdbx_vrpt_summary.entry_id                    1IOT
_pdbx_vrpt_summary.PDB_deposition_date         2001-03-28
_pdbx_vrpt_summary.PDB_revision_number         5
_pdbx_vrpt_summary.PDB_revision_date           2021-11-10
_pdbx_vrpt_summary.report_creation_date        2021-10-31:08:35
_pdbx_vrpt_summary.attempted_validation_steps  molprobity,validation-pack,xtriage,eds,percentiles,writexml,writecif,writepdf
_pdbx_vrpt_summary.ligands_for_buster_report   N
#
loop_
_pdbx_vrpt_entity.id
_pdbx_vrpt_entity.type
_pdbx_vrpt_entity.description
1  polymer  "LYSOZYME C"  
2  water    water  
#
loop_
_pdbx_vrpt_asym.label_asym_id
_pdbx_vrpt_asym.entity_id
A  1  
B  2  
#
loop_
_pdbx_vrpt_percentile_list.id
_pdbx_vrpt_percentile_list.range
_pdbx_vrpt_percentile_list.exp_method
1  all   x-ray  
2  1.75  x-ray  
#
loop_
_pdbx_vrpt_percentile_type.id
_pdbx_vrpt_percentile_type.type
1  all_atom_clashscore           
2  Ramachandran_outlier_percent  
3  rotamer_outliers_percent      
4  RSRZ_outliers_percent         
#
loop_
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.id
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.percentile_list_id
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.type_id
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.rank
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.number_entries_total
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.res_high
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.res_low
1  1  1   47.57  141614     ?     ?  
2  2  1   29.12    2466  1.76  1.76  
3  1  2  100.00  138981     ?     ?  
4  2  2  100.00    2437  1.76  1.76  
5  1  3  100.00  138945     ?     ?  
6  2  3  100.00    2437  1.76  1.76  
7  1  4  100.00  127900     ?     ?  
8  2  4  100.00    2298  1.76  1.76  
#
loop_
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.ordinal
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.conditions_id
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.type_id
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.label_asym_id
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.PDB_model_num
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.entity_id
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.auth_asym_id
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.rank
1  3  2  A  1  1  A  100.00  
2  4  2  A  1  1  A  100.00  
3  5  3  A  1  1  A  100.00  
4  6  3  A  1  1  A  100.00  
5  7  4  A  1  1  A  100.00  
6  8  4  A  1  1  A  100.00  
#
loop_
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.ordinal
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.PDB_model_num
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.entity_id
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.label_asym_id
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.auth_asym_id
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.angles_RMSZ
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.bonds_RMSZ
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.num_bonds_RMSZ
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.num_angles_RMSZ
1  1  1  A  A  0.69  0.48  1021  1380  
2  1  2  B  A     ?     ?     ?     ?  
#
_pdbx_vrpt_summary_geometry.ordinal                        1
_pdbx_vrpt_summary_geometry.percent_ramachandran_outliers  0.00
_pdbx_vrpt_summary_geometry.percent_rotamer_outliers       0.00
_pdbx_vrpt_summary_geometry.clashscore                     6.12
_pdbx_vrpt_summary_geometry.num_H_reduce                   961
_pdbx_vrpt_summary_geometry.num_bonds_RMSZ                 1021
_pdbx_vrpt_summary_geometry.bonds_RMSZ                     0.48
_pdbx_vrpt_summary_geometry.num_angles_RMSZ                1380
_pdbx_vrpt_summary_geometry.angles_RMSZ                    0.69
#
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.exp_method                x-ray
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.ordinal                   1
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.Babinet_b                 92.518
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.bulk_solvent_b            54.217
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.Wilson_B_estimate         22.313
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.I_over_sigma              1.91(1.79A)
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.num_miller_indices        10390
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.Babinet_k                 0.227
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.bulk_solvent_k            0.295
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.Padilla_Yeates_L_mean     0.477
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.Padilla_Yeates_L2_mean    0.309
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.Fo_Fc_correlation         0.969
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.DCC_R                     0.16
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.EDS_R                     0.16
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.EDS_res_high              1.80
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.EDS_res_low               35.40
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.Wilson_B_aniso            "[22.022,22.022,22.893,0.000,0.000,0.000]"
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.data_anisotropy           0.039
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.trans_NCS_details         "The largest off-origin peak in the Patterson function is 8.76% of the height of the origin peak. No significant pseudotranslation is detected."
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.B_factor_type             FULL
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.acentric_outliers         0
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.centric_outliers          0
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.data_completeness         88.95
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.number_reflns_R_free      0
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.percent_free_reflections  0.00
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.percent_RSRZ_outliers     0.00
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.PDB_resolution_high       1.75
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.PDB_R                     0.17
#
loop_
_pdbx_vrpt_model_instance.id
_pdbx_vrpt_model_instance.PDB_model_num
_pdbx_vrpt_model_instance.entity_id
_pdbx_vrpt_model_instance.label_asym_id
_pdbx_vrpt_model_instance.label_seq_id
_pdbx_vrpt_model_instance.label_comp_id
_pdbx_vrpt_model_instance.auth_asym_id
_pdbx_vrpt_model_instance.auth_seq_id
_pdbx_vrpt_model_instance.label_alt_id
_pdbx_vrpt_model_instance.PDB_ins_code
_pdbx_vrpt_model_instance.count_clashes
  1  1  1  A    1  LYS  A    1  .  ?        ?  
  2  1  1  A    2  VAL  A    2  .  ?        ?  
  3  1  1  A    3  PHE  A    3  .  ?        ?  
  4  1  1  A    4  GLY  A    4  .  ?        ?  
  5  1  1  A    5  ARG  A    5  .  ?        ?  
  6  1  1  A    6  CYS  A    6  .  ?        ?  
  7  1  1  A    7  GLU  A    7  .  ?        ?  
  8  1  1  A    8  LEU  A    8  .  ?        ?  
  9  1  1  A    9  ALA  A    9  .  ?        ?  
 10  1  1  A   10  ALA  A   10  .  ?        ?  
 11  1  1  A   11  ALA  A   11  .  ?        ?  
 12  1  1  A   12  LEU  A   12  .  ?        ?  
 13  1  1  A   13  LYS  A   13  .  ?        ?  
 14  1  1  A   14  ARG  A   14  .  ?        ?  
 15  1  1  A   15  HIS  A   15  .  ?        1  
 16  1  1  A   16  GLY  A   16  .  ?        ?  
 17  1  1  A   17  LEU  A   17  .  ?        ?  
 18  1  1  A   18  ASP  A   18  .  ?        ?  
 19  1  1  A   19  ASN  A   19  .  ?        ?  
 20  1  1  A   20  TYR  A   20  .  ?        2  
 21  1  1  A   21  ARG  A   21  .  ?        2  
 22  1  1  A   22  GLY  A   22  .  ?        ?  
 23  1  1  A   23  TYR  A   23  .  ?        ?  
 24  1  1  A   24  SER  A   24  .  ?        ?  
 25  1  1  A   25  LEU  A   25  .  ?        ?  
 26  1  1  A   26  GLY  A   26  .  ?        ?  
 27  1  1  A   27  ASN  A   27  .  ?        ?  
 28  1  1  A   28  TRP  A   28  .  ?        ?  
 29  1  1  A   29  VAL  A   29  .  ?        ?  
 30  1  1  A   30  CYS  A   30  .  ?        ?  
 31  1  1  A   31  ALA  A   31  .  ?        ?  
 32  1  1  A   32  ALA  A   32  .  ?        ?  
 33  1  1  A   33  LYS  A   33  .  ?        1  
 34  1  1  A   34  PHE  A   34  .  ?        ?  
 35  1  1  A   35  GLU  A   35  .  ?        ?  
 36  1  1  A   36  SER  A   36  .  ?        ?  
 37  1  1  A   37  ASN  A   37  .  ?        ?  
 38  1  1  A   38  PHE  A   38  .  ?        ?  
 39  1  1  A   39  ASN  A   39  .  ?        ?  
 40  1  1  A   40  THR  A   40  .  ?        ?  
 41  1  1  A   41  GLN  A   41  .  ?        ?  
 42  1  1  A   42  ALA  A   42  .  ?        ?  
 43  1  1  A   43  THR  A   43  .  ?        ?  
 44  1  1  A   44  ASN  A   44  .  ?        ?  
 45  1  1  A   45  ARG  A   45  .  ?        ?  
 46  1  1  A   46  ASN  A   46  .  ?        ?  
 47  1  1  A   47  THR  A   47  .  ?        ?  
 48  1  1  A   48  ASP  A   48  .  ?        1  
 49  1  1  A   49  GLY  A   49  .  ?        ?  
 50  1  1  A   50  SER  A   50  .  ?        ?  
 51  1  1  A   51  THR  A   51  .  ?        ?  
 52  1  1  A   52  ASP  A   52  .  ?        ?  
 53  1  1  A   53  TYR  A   53  .  ?        ?  
 54  1  1  A   54  GLY  A   54  .  ?        ?  
 55  1  1  A   55  ILE  A   55  .  ?        ?  
 56  1  1  A   56  LEU  A   56  .  ?        ?  
 57  1  1  A   57  GLN  A   57  .  ?        ?  
 58  1  1  A   58  ILE  A   58  .  ?        ?  
 59  1  1  A   59  ASN  A   59  .  ?        1  
 60  1  1  A   60  SER  A   60  .  ?        ?  
 61  1  1  A   61  ARG  A   61  .  ?        3  
 62  1  1  A   62  TRP  A   62  .  ?        ?  
 63  1  1  A   63  TRP  A   63  .  ?        1  
 64  1  1  A   64  CYS  A   64  .  ?        ?  
 65  1  1  A   65  ASN  A   65  .  ?        ?  
 66  1  1  A   66  ASP  A   66  .  ?        ?  
 67  1  1  A   67  GLY  A   67  .  ?        ?  
 68  1  1  A   68  ARG  A   68  .  ?        ?  
 69  1  1  A   69  THR  A   69  .  ?        ?  
 70  1  1  A   70  PRO  A   70  .  ?        ?  
 71  1  1  A   71  GLY  A   71  .  ?        ?  
 72  1  1  A   72  SER  A   72  .  ?        1  
 73  1  1  A   73  ARG  A   73  .  ?        ?  
 74  1  1  A   74  ASN  A   74  .  ?        ?  
 75  1  1  A   75  LEU  A   75  .  ?        ?  
 76  1  1  A   76  CYS  A   76  .  ?        ?  
 77  1  1  A   77  ASN  A   77  .  ?        ?  
 78  1  1  A   78  ILE  A   78  .  ?        1  
 79  1  1  A   79  PRO  A   79  .  ?        ?  
 80  1  1  A   80  CYS  A   80  .  ?        ?  
 81  1  1  A   81  SER  A   81  .  ?        ?  
 82  1  1  A   82  ALA  A   82  .  ?        ?  
 83  1  1  A   83  LEU  A   83  .  ?        1  
 84  1  1  A   84  LEU  A   84  .  ?        ?  
 85  1  1  A   85  SER  A   85  .  ?        ?  
 86  1  1  A   86  SER  A   86  .  ?        ?  
 87  1  1  A   87  ASP  A   87  .  ?        ?  
 88  1  1  A   88  ILE  A   88  .  ?        ?  
 89  1  1  A   89  THR  A   89  .  ?        ?  
 90  1  1  A   90  ALA  A   90  .  ?        ?  
 91  1  1  A   91  SER  A   91  .  ?        ?  
 92  1  1  A   92  VAL  A   92  .  ?        1  
 93  1  1  A   93  ASN  A   93  .  ?        ?  
 94  1  1  A   94  CYS  A   94  .  ?        ?  
 95  1  1  A   95  ALA  A   95  .  ?        ?  
 96  1  1  A   96  LYS  A   96  .  ?        ?  
 97  1  1  A   97  LYS  A   97  .  ?        ?  
 98  1  1  A   98  ILE  A   98  .  ?        1  
 99  1  1  A   99  VAL  A   99  .  ?        ?  
100  1  1  A  100  SER  A  100  .  ?        ?  
101  1  1  A  101  ASP  A  101  .  ?        ?  
102  1  1  A  102  GLY  A  102  .  ?        ?  
103  1  1  A  103  ASN  A  103  .  ?        ?  
104  1  1  A  104  GLY  A  104  .  ?        ?  
105  1  1  A  105  MET  A  105  .  ?        ?  
106  1  1  A  106  ASN  A  106  .  ?        ?  
107  1  1  A  107  ALA  A  107  .  ?        ?  
108  1  1  A  108  TRP  A  108  .  ?        ?  
109  1  1  A  109  VAL  A  109  .  ?        ?  
110  1  1  A  110  ALA  A  110  .  ?        ?  
111  1  1  A  111  TRP  A  111  .  ?        1  
112  1  1  A  112  ARG  A  112  .  ?        ?  
113  1  1  A  113  ASN  A  113  .  ?        ?  
114  1  1  A  114  ARG  A  114  .  ?        ?  
115  1  1  A  115  CYS  A  115  .  ?        1  
116  1  1  A  116  LYS  A  116  .  ?        ?  
117  1  1  A  117  GLY  A  117  .  ?        ?  
118  1  1  A  118  THR  A  118  .  ?        ?  
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115  115  m        -114.1   -44.7  Favored     ?     4  17.440     6  0.46     8  0.92  molprobity  1.000  
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117  117  ?          72.8    14.1  Favored     ?     3  26.720     4  0.36     5  0.46  molprobity  1.000  
118  118  p        -109.5   170.2  Favored     ?     7  24.230     7  0.61    10  0.73  molprobity  1.000  
119  119  t70       -79.7    82.3  Favored     ?     4  39.880     8  0.48    11  0.59  molprobity  1.000  
120  120  m         -65.7   -17.8  Favored     ?     9  25.780     7  0.51    10  0.45  molprobity  1.000  
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122  122  ?         -58.3   -27.4  Favored     ?     5  24.830     5  0.40     7  0.29  molprobity  1.000  
123  123  m95       -69.0   -18.4  Favored     ?    10  23.370    16  0.41    23  0.60  molprobity  1.000  
124  124  pt       -115.3     3.4  Favored     ?    11  25.770     8  0.23    11  0.45  molprobity  1.000  
125  125  ttm180    -60.3   135.4  Favored     ?    13  46.420    11  0.35    14  0.49  molprobity  1.000  
126  126  ?          84.0    -5.7  Favored     ?     3  28.990     4  0.50     5  0.56  molprobity  1.000  
127  127  m         -88.4   146.8  Favored     ?     4  28.280     6  0.30     8  0.50  molprobity  1.000  
128  128  ttt85     -90.5   104.7  Favored     ?    13  52.370    11  0.38    14  0.94  molprobity  1.000  
129  129  mt            ?       ?  ?           ?    11  47.490     8  0.68     8  0.55  molprobity  1.000  
130  130  ?             ?       ?  ?           ?     ?  30.840     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
131  131  ?             ?       ?  ?           ?     ?  26.960     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
132  132  ?             ?       ?  ?           ?     ?  21.720     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
133  133  ?             ?       ?  ?           ?     ?  36.990     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
134  134  ?             ?       ?  ?           ?     ?  40.720     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
135  135  ?             ?       ?  ?           ?     ?  11.520     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
136  136  ?             ?       ?  ?           ?     ?  18.170     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
137  137  ?             ?       ?  ?           ?     ?  27.040     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
138  138  ?             ?       ?  ?           ?     ?  23.160     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
139  139  ?             ?       ?  ?           ?     ?  28.790     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
140  140  ?             ?       ?  ?           ?     ?  21.370     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
141  141  ?             ?       ?  ?           ?     ?  30.380     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
142  142  ?             ?       ?  ?           ?     ?  39.450     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
143  143  ?             ?       ?  ?           ?     ?  17.240     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
144  144  ?             ?       ?  ?           ?     ?  19.380     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
145  145  ?             ?       ?  ?           ?     ?  32.340     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
146  146  ?             ?       ?  ?           ?     ?  16.690     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
147  147  ?             ?       ?  ?           ?     ?  22.530     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
148  148  ?             ?       ?  ?           ?     ?  24.390     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
149  149  ?             ?       ?  ?           ?     ?  32.420     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
150  150  ?             ?       ?  ?           ?     ?  25.370     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
151  151  ?             ?       ?  ?           ?     ?  30.500     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
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155  155  ?             ?       ?  ?           ?     ?  29.300     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
156  156  ?             ?       ?  ?           ?     ?  23.300     ?     ?     ?     ?  ?           1.000  
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