data_1HQP

_pdbx_vrpt_database.id    PDB
_pdbx_vrpt_database.code  1HQP
#
_pdbx_vrpt_exptl.ordinal  1
_pdbx_vrpt_exptl.method   x-ray
#
_pdbx_vrpt_summary.entry_id                    1HQP
_pdbx_vrpt_summary.PDB_deposition_date         2000-12-19
_pdbx_vrpt_summary.PDB_revision_number         5
_pdbx_vrpt_summary.PDB_revision_date           2023-08-09
_pdbx_vrpt_summary.report_creation_date        2023-08-03:08:29
_pdbx_vrpt_summary.attempted_validation_steps  molprobity,validation-pack,mogul,percentiles,writexml,writecif,writepdf
_pdbx_vrpt_summary.ligands_for_buster_report   N
#
loop_
_pdbx_vrpt_entity.id
_pdbx_vrpt_entity.type
_pdbx_vrpt_entity.description
1  polymer      "ODORANT-BINDING PROTEIN"  
2  non-polymer  2-ISOBUTYL-3-METHOXYPYRAZINE  
#
loop_
_pdbx_vrpt_asym.label_asym_id
_pdbx_vrpt_asym.entity_id
A  1  
B  2  
#
loop_
_pdbx_vrpt_percentile_list.id
_pdbx_vrpt_percentile_list.range
_pdbx_vrpt_percentile_list.exp_method
1  all  x-ray  
2  2.3  x-ray  
#
loop_
_pdbx_vrpt_percentile_type.id
_pdbx_vrpt_percentile_type.type
1  all_atom_clashscore           
2  Ramachandran_outlier_percent  
3  rotamer_outliers_percent      
#
loop_
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.id
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.percentile_list_id
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.type_id
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.rank
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.number_entries_total
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.res_high
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.res_low
1  1  1   0.93  141614     ?     ?  
2  2  1   0.41    5643  2.30  2.30  
3  1  2   7.15  138981     ?     ?  
4  2  2   5.94    5575  2.30  2.30  
5  1  3  27.36  138945     ?     ?  
6  2  3  38.58    5575  2.30  2.30  
#
loop_
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.ordinal
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.conditions_id
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.type_id
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.label_asym_id
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.PDB_model_num
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.entity_id
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.auth_asym_id
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.rank
1  3  2  A  1  1  A   7.15  
2  4  2  A  1  1  A   5.94  
3  5  3  A  1  1  A  27.36  
4  6  3  A  1  1  A  38.58  
#
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.ordinal          1
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.PDB_model_num    1
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.entity_id        1
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.label_asym_id    A
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.auth_asym_id     A
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.angles_RMSZ      0.77
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.bonds_RMSZ       2.82
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.num_bonds_RMSZ   1198
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.num_angles_RMSZ  1613
#
_pdbx_vrpt_summary_geometry.ordinal                        1
_pdbx_vrpt_summary_geometry.percent_ramachandran_outliers  2.04
_pdbx_vrpt_summary_geometry.percent_rotamer_outliers       4.55
_pdbx_vrpt_summary_geometry.clashscore                     53.26
_pdbx_vrpt_summary_geometry.num_H_reduce                   1137
_pdbx_vrpt_summary_geometry.num_bonds_RMSZ                 1198
_pdbx_vrpt_summary_geometry.bonds_RMSZ                     2.82
_pdbx_vrpt_summary_geometry.num_angles_RMSZ                1613
_pdbx_vrpt_summary_geometry.angles_RMSZ                    0.77
#
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.exp_method           x-ray
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.ordinal              1
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.PDB_resolution_high  2.30
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.PDB_resolution_low   10.00
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.PDB_R                0.20
#
loop_
_pdbx_vrpt_model_instance.id
_pdbx_vrpt_model_instance.PDB_model_num
_pdbx_vrpt_model_instance.entity_id
_pdbx_vrpt_model_instance.label_asym_id
_pdbx_vrpt_model_instance.label_seq_id
_pdbx_vrpt_model_instance.label_comp_id
_pdbx_vrpt_model_instance.auth_asym_id
_pdbx_vrpt_model_instance.auth_seq_id
_pdbx_vrpt_model_instance.label_alt_id
_pdbx_vrpt_model_instance.PDB_ins_code
_pdbx_vrpt_model_instance.count_bond_outliers
_pdbx_vrpt_model_instance.count_clashes
_pdbx_vrpt_model_instance.count_mogul_bond_outliers
_pdbx_vrpt_model_instance.count_mogul_angle_outliers
  1  1  1  A    9  PRO  A    9  .  ?        ?     ?     ?     ?  
  2  1  1  A   10  PHE  A   10  .  ?        ?     1     ?     ?  
  3  1  1  A   11  GLU  A   11  .  ?        ?     ?     ?     ?  
  4  1  1  A   12  LEU  A   12  .  ?        ?     4     ?     ?  
  5  1  1  A   13  SER  A   13  .  ?        ?     ?     ?     ?  
  6  1  1  A   14  GLY  A   14  .  ?        ?     ?     ?     ?  
  7  1  1  A   15  LYS  A   15  .  ?        ?     1     ?     ?  
  8  1  1  A   16  TRP  A   16  .  ?        ?     3     ?     ?  
  9  1  1  A   17  ILE  A   17  .  ?        ?     1     ?     ?  
 10  1  1  A   18  THR  A   18  .  ?        ?     1     ?     ?  
 11  1  1  A   19  SER  A   19  .  ?        ?     ?     ?     ?  
 12  1  1  A   20  TYR  A   20  .  ?        ?     ?     ?     ?  
 13  1  1  A   21  ILE  A   21  .  ?        ?     5     ?     ?  
 14  1  1  A   22  GLY  A   22  .  ?        ?     1     ?     ?  
 15  1  1  A   23  SER  A   23  .  ?        ?     ?     ?     ?  
 16  1  1  A   24  SER  A   24  .  ?        ?     3     ?     ?  
 17  1  1  A   25  ASP  A   25  .  ?        ?     1     ?     ?  
 18  1  1  A   26  LEU  A   26  .  ?        ?     3     ?     ?  
 19  1  1  A   27  GLU  A   27  .  ?        ?     1     ?     ?  
 20  1  1  A   28  LYS  A   28  .  ?        ?     ?     ?     ?  
 21  1  1  A   29  ILE  A   29  .  ?        ?     3     ?     ?  
 22  1  1  A   30  GLY  A   30  .  ?        ?     ?     ?     ?  
 23  1  1  A   31  GLU  A   31  .  ?        ?     4     ?     ?  
 24  1  1  A   32  ASN  A   32  .  ?        ?     5     ?     ?  
 25  1  1  A   33  ALA  A   33  .  ?        ?     ?     ?     ?  
 26  1  1  A   34  PRO  A   34  .  ?        ?     ?     ?     ?  
 27  1  1  A   35  PHE  A   35  .  ?        ?     1     ?     ?  
 28  1  1  A   36  GLN  A   36  .  ?        ?     3     ?     ?  
 29  1  1  A   37  VAL  A   37  .  ?        ?     2     ?     ?  
 30  1  1  A   38  PHE  A   38  .  ?        ?     2     ?     ?  
 31  1  1  A   39  MET  A   39  .  ?        ?     5     ?     ?  
 32  1  1  A   40  ARG  A   40  .  ?        ?     ?     ?     ?  
 33  1  1  A   41  SER  A   41  .  ?        ?     ?     ?     ?  
 34  1  1  A   42  ILE  A   42  .  ?        ?     ?     ?     ?  
 35  1  1  A   43  GLU  A   43  .  ?        ?     4     ?     ?  
 36  1  1  A   44  PHE  A   44  .  ?        ?     ?     ?     ?  
 37  1  1  A   45  ASP  A   45  .  ?        ?     1     ?     ?  
 38  1  1  A   46  ASP  A   46  .  ?        ?     ?     ?     ?  
 39  1  1  A   47  LYS  A   47  .  ?        ?     1     ?     ?  
 40  1  1  A   48  GLU  A   48  .  ?        ?     ?     ?     ?  
 41  1  1  A   49  SER  A   49  .  ?        ?     1     ?     ?  
 42  1  1  A   50  LYS  A   50  .  ?        ?     2     ?     ?  
 43  1  1  A   51  VAL  A   51  .  ?        ?     2     ?     ?  
 44  1  1  A   52  TYR  A   52  .  ?        ?     2     ?     ?  
 45  1  1  A   53  LEU  A   53  .  ?        ?     2     ?     ?  
 46  1  1  A   54  ASN  A   54  .  ?        ?     2     ?     ?  
 47  1  1  A   55  PHE  A   55  .  ?        ?     1     ?     ?  
 48  1  1  A   56  PHE  A   56  .  ?        ?     ?     ?     ?  
 49  1  1  A   57  SER  A   57  .  ?        ?     ?     ?     ?  
 50  1  1  A   58  LYS  A   58  .  ?        ?     1     ?     ?  
 51  1  1  A   59  GLU  A   59  .  ?        ?     1     ?     ?  
 52  1  1  A   60  ASN  A   60  .  ?        ?     1     ?     ?  
 53  1  1  A   61  GLY  A   61  .  ?        ?     2     ?     ?  
 54  1  1  A   62  ILE  A   62  .  ?        ?     2     ?     ?  
 55  1  1  A   63  CYS  A   63  .  ?        ?     2     ?     ?  
 56  1  1  A   64  GLU  A   64  .  ?        ?     1     ?     ?  
 57  1  1  A   65  GLU  A   65  .  ?        ?     2     ?     ?  
 58  1  1  A   66  PHE  A   66  .  ?        ?     ?     ?     ?  
 59  1  1  A   67  SER  A   67  .  ?        ?     ?     ?     ?  
 60  1  1  A   68  LEU  A   68  .  ?        ?     4     ?     ?  
 61  1  1  A   69  ILE  A   69  .  ?        ?     3     ?     ?  
 62  1  1  A   70  GLY  A   70  .  ?        ?     ?     ?     ?  
 63  1  1  A   71  THR  A   71  .  ?        ?     2     ?     ?  
 64  1  1  A   72  LYS  A   72  .  ?        ?    15     ?     ?  
 65  1  1  A   73  GLN  A   73  .  ?        ?     2     ?     ?  
 66  1  1  A   74  GLU  A   74  .  ?        ?     ?     ?     ?  
 67  1  1  A   75  GLY  A   75  .  ?        ?     ?     ?     ?  
 68  1  1  A   76  ASN  A   76  .  ?        ?     1     ?     ?  
 69  1  1  A   77  THR  A   77  .  ?        ?     2     ?     ?  
 70  1  1  A   78  TYR  A   78  .  ?        ?     3     ?     ?  
 71  1  1  A   79  ASP  A   79  .  ?        ?     2     ?     ?  
 72  1  1  A   80  VAL  A   80  .  ?        ?     7     ?     ?  
 73  1  1  A   81  ASN  A   81  .  ?        ?     ?     ?     ?  
 74  1  1  A   82  TYR  A   82  .  ?        ?     3     ?     ?  
 75  1  1  A   83  ALA  A   83  .  ?        ?     ?     ?     ?  
 76  1  1  A   84  GLY  A   84  .  ?        ?     2     ?     ?  
 77  1  1  A   85  ASN  A   85  .  ?        ?     ?     ?     ?  
 78  1  1  A   86  ASN  A   86  .  ?        ?     5     ?     ?  
 79  1  1  A   87  LYS  A   87  .  ?        ?     3     ?     ?  
 80  1  1  A   88  PHE  A   88  .  ?        ?     5     ?     ?  
 81  1  1  A   89  VAL  A   89  .  ?        ?     1     ?     ?  
 82  1  1  A   90  VAL  A   90  .  ?        ?     ?     ?     ?  
 83  1  1  A   91  SER  A   91  .  ?        ?     ?     ?     ?  
 84  1  1  A   92  TYR  A   92  .  ?        ?     ?     ?     ?  
 85  1  1  A   93  ALA  A   93  .  ?        ?     ?     ?     ?  
 86  1  1  A   94  SER  A   94  .  ?        ?     ?     ?     ?  
 87  1  1  A   95  GLU  A   95  .  ?        ?     1     ?     ?  
 88  1  1  A   96  THR  A   96  .  ?        ?     ?     ?     ?  
 89  1  1  A   97  ALA  A   97  .  ?        ?     ?     ?     ?  
 90  1  1  A   98  LEU  A   98  .  ?        ?     3     ?     ?  
 91  1  1  A   99  ILE  A   99  .  ?        ?     4     ?     ?  
 92  1  1  A  100  ILE  A  100  .  ?        ?     5     ?     ?  
 93  1  1  A  101  SER  A  101  .  ?        ?     3     ?     ?  
 94  1  1  A  102  ASN  A  102  .  ?        ?     6     ?     ?  
 95  1  1  A  103  ILE  A  103  .  ?        ?     ?     ?     ?  
 96  1  1  A  104  ASN  A  104  .  ?        ?     ?     ?     ?  
 97  1  1  A  105  VAL  A  105  .  ?        ?     ?     ?     ?  
 98  1  1  A  106  ASP  A  106  .  ?        ?     1     ?     ?  
 99  1  1  A  107  GLU  A  107  .  ?        ?     ?     ?     ?  
100  1  1  A  108  GLU  A  108  .  ?        ?     1     ?     ?  
101  1  1  A  109  GLY  A  109  .  ?        ?     ?     ?     ?  
102  1  1  A  110  ASP  A  110  .  ?        ?     ?     ?     ?  
103  1  1  A  111  LYS  A  111  .  ?        ?     ?     ?     ?  
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 72   72  p        -154.9   143.5  Favored     ?   9   7   0.19  10  0.77  molprobity  
 73   73  t-20     -104.0   128.6  Favored     ?   6   8   0.30  11  0.54  molprobity  
 74   74  t80       176.8   124.2  OUTLIER     ?   9  13   0.21  18  0.47  molprobity  
 75   75  ?          60.1     1.4  Allowed     ?   5   5   0.11   7  0.45  molprobity  
 76   76  ?         143.1  -161.4  Favored     ?   3   4   0.44   5  1.67  molprobity  
 77   77  t-20      -80.9   158.2  Favored     ?   6   8   0.30  11  0.53  molprobity  
 78   78  m-20     -145.4   143.7  Favored     ?   6   8   0.26  11  0.43  molprobity  
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 80   80  p90      -140.7   160.7  Favored     ?   9  12   0.30  16  0.33  molprobity  
 81   81  p        -152.6   144.8  Favored     ?   9   7   0.19  10  1.14  molprobity  
 82   82  t         -79.6    98.2  Favored     ?   9   7   0.23  10  0.96  molprobity  
 83   83  m         -67.5   -10.0  Favored     ?   5   6   0.22   8  0.58  molprobity  
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 87   87  mt-10     -66.5   -33.1  Favored     ?   6   9   0.27  12  0.44  molprobity  
 88   88  p         -89.8   -21.1  Favored     ?   7   7   0.20  10  1.42  molprobity  
 89   89  ?        -144.5   168.4  Favored     ?   5   5   0.18   7  0.81  molprobity  
 90   90  tp       -141.7   108.7  Favored     ?  11   8   0.20  11  0.75  molprobity  
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 93   93  m        -133.1   138.2  Favored     ?   5   6   0.33   8  0.87  molprobity  
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 97   97  t        -134.3   111.9  Favored     ?   9   7   0.29  10  1.16  molprobity  
 98   98  p30       -77.3   169.8  Favored     ?   4   8   0.20  11  1.06  molprobity  
 99   99  mt-10     -68.2    17.8  OUTLIER     ?   6   9   0.31  12  0.56  molprobity  
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103  103  tttp      -92.5   139.0  Favored     ?  13   9   0.27  11  1.10  molprobity  
104  104  m        -148.3   132.3  Favored     ?   7   7   0.45  10  0.89  molprobity  
105  105  tp       -106.3   130.4  Favored     ?  11   8   0.21  11  0.47  molprobity  
106  106  mtm      -133.6   161.3  Favored     ?   9   8   0.24  10  0.88  molprobity  
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108  108  ?        -140.1   116.2  Allowed     ?   3   4   0.30   5  0.65  molprobity  
109  109  tp        -88.2   115.2  Favored     ?  11   8   0.23  11  0.67  molprobity  
110  110  mm?      -108.8   145.7  Favored     ?  11   8   0.22  11  0.44  molprobity  
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149  149  ?             ?       ?  ?           ?   5   5  43.43   4  0.21  molprobity  
150  150  ?             ?       ?  ?           ?  14  11   1.40  12  2.26  mogul       
#
loop_
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##
