data_1DY3

loop_
_pdbx_vrpt_database.id
_pdbx_vrpt_database.code
PDB   1DY3      
PDBE  EBI-4524  
#
_pdbx_vrpt_exptl.ordinal  1
_pdbx_vrpt_exptl.method   x-ray
#
_pdbx_vrpt_summary.entry_id                    1DY3
_pdbx_vrpt_summary.PDB_deposition_date         2000-01-21
_pdbx_vrpt_summary.PDB_revision_number         4
_pdbx_vrpt_summary.PDB_revision_date           2024-05-08
_pdbx_vrpt_summary.report_creation_date        2024-04-30:18:53
_pdbx_vrpt_summary.attempted_validation_steps  molprobity,validation-pack,mogul,buster-report,percentiles,writexml,writecif,writepdf
_pdbx_vrpt_summary.ligands_for_buster_report   Y
#
loop_
_pdbx_vrpt_entity.id
_pdbx_vrpt_entity.type
_pdbx_vrpt_entity.description
1  polymer      "2-amino-4-hydroxy-6-hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase"  
2  non-polymer  "ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE"  
3  non-polymer  7,8-DIHYDRO-6-HYDROXYMETHYL-7-METHYL-7-[2-PHENYLETHYL]-PTERIN  
4  non-polymer  "MAGNESIUM ION"  
5  water        water  
#
loop_
_pdbx_vrpt_asym.label_asym_id
_pdbx_vrpt_asym.entity_id
A  1  
B  2  
C  3  
D  4  
E  4  
F  5  
#
loop_
_pdbx_vrpt_percentile_list.id
_pdbx_vrpt_percentile_list.range
_pdbx_vrpt_percentile_list.exp_method
1  all  x-ray  
2  2.0  x-ray  
#
loop_
_pdbx_vrpt_percentile_type.id
_pdbx_vrpt_percentile_type.type
1  all_atom_clashscore           
2  Ramachandran_outlier_percent  
3  rotamer_outliers_percent      
#
loop_
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.id
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.percentile_list_id
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.type_id
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.rank
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.number_entries_total
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.res_high
_pdbx_vrpt_percentile_conditions.res_low
1  1  1   39.72  141614     ?     ?  
2  2  1   39.39    9178  2.00  2.00  
3  1  2  100.00  138981     ?     ?  
4  2  2  100.00    9054  2.00  2.00  
5  1  3   28.08  138945     ?     ?  
6  2  3   25.00    9053  2.00  2.00  
#
loop_
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.ordinal
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.conditions_id
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.type_id
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.label_asym_id
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.PDB_model_num
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.entity_id
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.auth_asym_id
_pdbx_vrpt_percentile_entity_view.rank
1  3  2  A  1  1  A  100.00  
2  4  2  A  1  1  A  100.00  
3  5  3  A  1  1  A   28.08  
4  6  3  A  1  1  A   25.00  
#
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.ordinal          1
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.PDB_model_num    1
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.entity_id        1
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.label_asym_id    A
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.auth_asym_id     A
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.angles_RMSZ      1.41
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.bonds_RMSZ       0.66
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.num_bonds_RMSZ   1298
_pdbx_vrpt_summary_entity_geometry.num_angles_RMSZ  1767
#
_pdbx_vrpt_summary_geometry.ordinal                        1
_pdbx_vrpt_summary_geometry.percent_ramachandran_outliers  0.00
_pdbx_vrpt_summary_geometry.percent_rotamer_outliers       4.38
_pdbx_vrpt_summary_geometry.clashscore                     7.25
_pdbx_vrpt_summary_geometry.num_H_reduce                   1299
_pdbx_vrpt_summary_geometry.num_bonds_RMSZ                 1298
_pdbx_vrpt_summary_geometry.bonds_RMSZ                     0.66
_pdbx_vrpt_summary_geometry.num_angles_RMSZ                1767
_pdbx_vrpt_summary_geometry.angles_RMSZ                    1.41
#
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.exp_method           x-ray
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.ordinal              1
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.PDB_resolution_high  2.00
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.PDB_resolution_low   10.00
_pdbx_vrpt_summary_diffraction.PDB_R                0.17
#
loop_
_pdbx_vrpt_model_instance.id
_pdbx_vrpt_model_instance.PDB_model_num
_pdbx_vrpt_model_instance.entity_id
_pdbx_vrpt_model_instance.label_asym_id
_pdbx_vrpt_model_instance.label_seq_id
_pdbx_vrpt_model_instance.label_comp_id
_pdbx_vrpt_model_instance.auth_asym_id
_pdbx_vrpt_model_instance.auth_seq_id
_pdbx_vrpt_model_instance.label_alt_id
_pdbx_vrpt_model_instance.PDB_ins_code
_pdbx_vrpt_model_instance.count_angle_outliers
_pdbx_vrpt_model_instance.count_clashes
_pdbx_vrpt_model_instance.count_mogul_bond_outliers
_pdbx_vrpt_model_instance.count_mogul_angle_outliers
_pdbx_vrpt_model_instance.count_mogul_torsion_outliers
  1  1  1  A    1  THR  A     1  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
  2  1  1  A    2  VAL  A     2  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
  3  1  1  A    3  ALA  A     3  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
  4  1  1  A    4  TYR  A     4  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
  5  1  1  A    5  ILE  A     5  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
  6  1  1  A    6  ALA  A     6  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
  7  1  1  A    7  ILE  A     7  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
  8  1  1  A    8  GLY  A     8  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
  9  1  1  A    9  SER  A     9  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 10  1  1  A   10  ASN  A    10  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 11  1  1  A   11  LEU  A    11  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 12  1  1  A   12  ALA  A    12  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 13  1  1  A   13  SER  A    13  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 14  1  1  A   14  PRO  A    14  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 15  1  1  A   15  LEU  A    15  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 16  1  1  A   16  GLU  A    16  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 17  1  1  A   17  GLN  A    17  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 18  1  1  A   18  VAL  A    18  .  ?        ?     1     ?     ?     ?  
 19  1  1  A   19  ASN  A    19  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 20  1  1  A   20  ALA  A    20  .  ?        ?     1     ?     ?     ?  
 21  1  1  A   21  ALA  A    21  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 22  1  1  A   22  LEU  A    22  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 23  1  1  A   23  LYS  A    23  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 24  1  1  A   24  ALA  A    24  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 25  1  1  A   25  LEU  A    25  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 26  1  1  A   26  GLY  A    26  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 27  1  1  A   27  ASP  A    27  .  ?        2     ?     ?     ?     ?  
 28  1  1  A   28  ILE  A    28  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 29  1  1  A   29  PRO  A    29  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 30  1  1  A   30  GLU  A    30  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 31  1  1  A   31  SER  A    31  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 32  1  1  A   32  HIS  A    32  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 33  1  1  A   33  ILE  A    33  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 34  1  1  A   34  LEU  A    34  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 35  1  1  A   35  THR  A    35  .  ?        1     2     ?     ?     ?  
 36  1  1  A   36  VAL  A    36  .  ?        ?     2     ?     ?     ?  
 37  1  1  A   37  SER  A    37  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 38  1  1  A   38  SER  A    38  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 39  1  1  A   39  PHE  A    39  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 40  1  1  A   40  TYR  A    40  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 41  1  1  A   41  ARG  A    41  .  ?        ?     1     ?     ?     ?  
 42  1  1  A   42  THR  A    42  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 43  1  1  A   43  PRO  A    43  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 44  1  1  A   44  PRO  A    44  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 45  1  1  A   45  LEU  A    45  .  ?        ?     1     ?     ?     ?  
 46  1  1  A   46  GLY  A    46  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 47  1  1  A   47  PRO  A    47  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 48  1  1  A   48  GLN  A    48  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 49  1  1  A   49  ASP  A    49  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 50  1  1  A   50  GLN  A    50  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 51  1  1  A   51  PRO  A    51  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 52  1  1  A   52  ASP  A    52  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 53  1  1  A   53  TYR  A    53  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 54  1  1  A   54  LEU  A    54  .  ?        ?     1     ?     ?     ?  
 55  1  1  A   55  ASN  A    55  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 56  1  1  A   56  ALA  A    56  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 57  1  1  A   57  ALA  A    57  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 58  1  1  A   58  VAL  A    58  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 59  1  1  A   59  ALA  A    59  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 60  1  1  A   60  LEU  A    60  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 61  1  1  A   61  GLU  A    61  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 62  1  1  A   62  THR  A    62  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 63  1  1  A   63  SER  A    63  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 64  1  1  A   64  LEU  A    64  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 65  1  1  A   65  ALA  A    65  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 66  1  1  A   66  PRO  A    66  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 67  1  1  A   67  GLU  A    67  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 68  1  1  A   68  GLU  A    68  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 69  1  1  A   69  LEU  A    69  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 70  1  1  A   70  LEU  A    70  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 71  1  1  A   71  ASN  A    71  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 72  1  1  A   72  HIS  A    72  .  ?        ?     2     ?     ?     ?  
 73  1  1  A   73  THR  A    73  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 74  1  1  A   74  GLN  A    74  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 75  1  1  A   75  ARG  A    75  .  ?        1     3     ?     ?     ?  
 76  1  1  A   76  ILE  A    76  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 77  1  1  A   77  GLU  A    77  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 78  1  1  A   78  LEU  A    78  .  ?        ?     1     ?     ?     ?  
 79  1  1  A   79  GLN  A    79  .  ?        ?     1     ?     ?     ?  
 80  1  1  A   80  GLN  A    80  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 81  1  1  A   81  GLY  A    81  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 82  1  1  A   82  ARG  A    82  .  ?        1     ?     ?     ?     ?  
 83  1  1  A   83  VAL  A    83  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 84  1  1  A   84  ARG  A    84  .  ?        1     ?     ?     ?     ?  
 85  1  1  A   85  LYS  A    85  .  ?        1     ?     ?     ?     ?  
 86  1  1  A   86  ALA  A    86  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 87  1  1  A   87  GLU  A    87  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 88  1  1  A   88  ARG  A    88  .  ?        2     ?     ?     ?     ?  
 89  1  1  A   89  TRP  A    89  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 90  1  1  A   90  GLY  A    90  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 91  1  1  A   91  PRO  A    91  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 92  1  1  A   92  ARG  A    92  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 93  1  1  A   93  THR  A    93  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 94  1  1  A   94  LEU  A    94  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 95  1  1  A   95  ASP  A    95  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 96  1  1  A   96  LEU  A    96  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 97  1  1  A   97  ASP  A    97  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 98  1  1  A   98  ILE  A    98  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
 99  1  1  A   99  MET  A    99  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
100  1  1  A  100  LEU  A   100  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
101  1  1  A  101  PHE  A   101  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
102  1  1  A  102  GLY  A   102  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
103  1  1  A  103  ASN  A   103  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
104  1  1  A  104  GLU  A   104  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
105  1  1  A  105  VAL  A   105  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
106  1  1  A  106  ILE  A   106  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
107  1  1  A  107  ASN  A   107  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
108  1  1  A  108  THR  A   108  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
109  1  1  A  109  GLU  A   109  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
110  1  1  A  110  ARG  A   110  .  ?        1     ?     ?     ?     ?  
111  1  1  A  111  LEU  A   111  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
112  1  1  A  112  THR  A   112  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
113  1  1  A  113  VAL  A   113  .  ?        ?     1     ?     ?     ?  
114  1  1  A  114  PRO  A   114  .  ?        ?     1     ?     ?     ?  
115  1  1  A  115  HIS  A   115  .  ?        ?     2     ?     ?     ?  
116  1  1  A  116  TYR  A   116  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
117  1  1  A  117  ASP  A   117  .  ?        ?     2     ?     ?     ?  
118  1  1  A  118  MET  A   118  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
119  1  1  A  119  LYS  A   119  .  ?        ?     2     ?     ?     ?  
120  1  1  A  120  ASN  A   120  .  ?        ?     1     ?     ?     ?  
121  1  1  A  121  ARG  A   121  .  ?        ?     1     ?     ?     ?  
122  1  1  A  122  GLY  A   122  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
123  1  1  A  123  PHE  A   123  .  ?        ?     1     ?     ?     ?  
124  1  1  A  124  MET  A   124  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
125  1  1  A  125  LEU  A   125  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
126  1  1  A  126  TRP  A   126  .  ?        ?     1     ?     ?     ?  
127  1  1  A  127  PRO  A   127  .  ?        ?     1     ?     ?     ?  
128  1  1  A  128  LEU  A   128  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
129  1  1  A  129  PHE  A   129  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
130  1  1  A  130  GLU  A   130  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
131  1  1  A  131  ILE  A   131  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
132  1  1  A  132  ALA  A   132  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
133  1  1  A  133  PRO  A   133  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
134  1  1  A  134  GLU  A   134  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
135  1  1  A  135  LEU  A   135  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
136  1  1  A  136  VAL  A   136  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
137  1  1  A  137  PHE  A   137  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
138  1  1  A  138  PRO  A   138  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
139  1  1  A  139  ASP  A   139  .  ?        ?     1     ?     ?     ?  
140  1  1  A  140  GLY  A   140  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
141  1  1  A  141  GLU  A   141  .  ?        ?     1     ?     ?     ?  
142  1  1  A  142  MET  A   142  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
143  1  1  A  143  LEU  A   143  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
144  1  1  A  144  ARG  A   144  .  ?        1     ?     ?     ?     ?  
145  1  1  A  145  GLN  A   145  .  ?        ?     1     ?     ?     ?  
146  1  1  A  146  ILE  A   146  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
147  1  1  A  147  LEU  A   147  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
148  1  1  A  148  HIS  A   148  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
149  1  1  A  149  THR  A   149  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
150  1  1  A  150  ARG  A   150  .  ?        ?     1     ?     ?     ?  
151  1  1  A  151  ALA  A   151  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
152  1  1  A  152  PHE  A   152  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
153  1  1  A  153  ASP  A   153  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
154  1  1  A  154  LYS  A   154  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
155  1  1  A  155  LEU  A   155  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
156  1  1  A  156  ASN  A   156  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
157  1  1  A  157  LYS  A   157  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
158  1  1  A  158  TRP  A   158  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
159  1  2  B    .  ATP  A   200  .  ?        ?     ?     5     7     ?  
160  1  3  C    .  87Y  A   201  .  ?        ?     1     4    15     1  
161  1  4  D    .  MG   A   202  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
162  1  4  E    .  MG   A   203  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
163  1  5  F    .  HOH  A  2001  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
164  1  5  F    .  HOH  A  2002  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
165  1  5  F    .  HOH  A  2003  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
166  1  5  F    .  HOH  A  2004  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
167  1  5  F    .  HOH  A  2005  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
168  1  5  F    .  HOH  A  2006  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
169  1  5  F    .  HOH  A  2007  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
170  1  5  F    .  HOH  A  2008  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
171  1  5  F    .  HOH  A  2009  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
172  1  5  F    .  HOH  A  2010  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
173  1  5  F    .  HOH  A  2011  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
174  1  5  F    .  HOH  A  2012  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
175  1  5  F    .  HOH  A  2013  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
176  1  5  F    .  HOH  A  2014  .  ?        ?     1     ?     ?     ?  
177  1  5  F    .  HOH  A  2015  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
178  1  5  F    .  HOH  A  2016  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
179  1  5  F    .  HOH  A  2017  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
180  1  5  F    .  HOH  A  2018  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
181  1  5  F    .  HOH  A  2019  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
182  1  5  F    .  HOH  A  2020  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
183  1  5  F    .  HOH  A  2021  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
184  1  5  F    .  HOH  A  2022  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
185  1  5  F    .  HOH  A  2023  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
186  1  5  F    .  HOH  A  2024  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
187  1  5  F    .  HOH  A  2025  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
188  1  5  F    .  HOH  A  2026  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
189  1  5  F    .  HOH  A  2027  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
190  1  5  F    .  HOH  A  2028  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
191  1  5  F    .  HOH  A  2029  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
192  1  5  F    .  HOH  A  2030  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
193  1  5  F    .  HOH  A  2031  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
194  1  5  F    .  HOH  A  2032  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
195  1  5  F    .  HOH  A  2033  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
196  1  5  F    .  HOH  A  2034  .  ?        ?     1     ?     ?     ?  
197  1  5  F    .  HOH  A  2035  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
198  1  5  F    .  HOH  A  2036  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
199  1  5  F    .  HOH  A  2037  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
200  1  5  F    .  HOH  A  2038  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
201  1  5  F    .  HOH  A  2039  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
202  1  5  F    .  HOH  A  2040  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
203  1  5  F    .  HOH  A  2041  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
204  1  5  F    .  HOH  A  2042  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
205  1  5  F    .  HOH  A  2043  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
206  1  5  F    .  HOH  A  2044  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
207  1  5  F    .  HOH  A  2045  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
208  1  5  F    .  HOH  A  2046  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
209  1  5  F    .  HOH  A  2047  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
210  1  5  F    .  HOH  A  2048  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
211  1  5  F    .  HOH  A  2049  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
212  1  5  F    .  HOH  A  2050  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
213  1  5  F    .  HOH  A  2051  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
214  1  5  F    .  HOH  A  2052  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
215  1  5  F    .  HOH  A  2053  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
216  1  5  F    .  HOH  A  2054  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
217  1  5  F    .  HOH  A  2055  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
218  1  5  F    .  HOH  A  2056  .  ?        ?     ?     ?     ?     ?  
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159  159  ?             ?       ?  ?           ?  ?     12  26  1.39  31  1.54  mogul       
160  160  ?             ?       ?  ?           ?  ?     19  20  1.78  21  4.49  mogul       
#
loop_
_pdbx_vrpt_instance_clashes.ordinal
_pdbx_vrpt_instance_clashes.instance_id
_pdbx_vrpt_instance_clashes.label_atom_id
_pdbx_vrpt_instance_clashes.cid
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_pdbx_vrpt_instance_clashes.dist
 1   18  HG21   1  0.54  1.90  
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10   72  HD2    7  0.86  1.23  
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16   79  HG3    9  0.46  2.15  
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24  119  NZ    15  0.50  2.39  
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37  231  O     10  0.40  2.22  
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#
loop_
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_pdbx_vrpt_instance_intra_angle_outliers.instance_id
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_pdbx_vrpt_instance_intra_angle_outliers.Z
 1   27  CA  CB  CG   136.534  113.400  2.200  10.52  
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 3   35  CB  CA  C     96.561  111.600  2.700  -5.57  
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 9   88  N   CA  C    130.487  111.000  2.700   7.22  
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11  144  CD  NE  CZ   157.560  123.600  1.400  24.26  
#
loop_
_pdbx_vrpt_instance_mogul_bond_outliers.ordinal
_pdbx_vrpt_instance_mogul_bond_outliers.instance_id
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_pdbx_vrpt_instance_mogul_bond_outliers.Zscore
_pdbx_vrpt_instance_mogul_bond_outliers.mindiff
1  159  PB   O2B  1.43  1.55   576  0.05  -2.48  0.00  
2  159  PA   O1A  1.42  1.50   576  0.04  -2.26  0.01  
3  159  C8   N7   1.30  1.34    73  0.02  -2.57  0.01  
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9  160  C1   N4   1.31  1.35  4699  0.02  -2.13  0.00  
#
loop_
_pdbx_vrpt_instance_mogul_angle_outliers.ordinal
_pdbx_vrpt_instance_mogul_angle_outliers.instance_id
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_pdbx_vrpt_instance_mogul_angle_outliers.Zscore
_pdbx_vrpt_instance_mogul_angle_outliers.mindiff
 1  159  O2A    PA     O1A    101.69  112.24    112  4.94  -2.13  0.71  
 2  159  PA     O3A    PB     123.71  132.83     29  3.43  -2.66  3.81  
 3  159  "O2'"  "C2'"  "C3'"  104.76  111.82   2473  3.23  -2.18  0.00  
 4  159  "O4'"  "C1'"  "C2'"  103.67  106.93     21  1.46  -2.23  0.33  
 5  159  "C1'"  N9     C4     131.27  126.64     30  1.76   2.64  0.63  
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14  160  C7     C6     N9     126.55  119.34     21  2.48   2.91  1.67  
15  160  C7     C6     N4     114.09  120.26    118  2.45  -2.51  0.11  
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#
_pdbx_vrpt_instance_mogul_torsion_outliers.ordinal        1
_pdbx_vrpt_instance_mogul_torsion_outliers.instance_id    160
_pdbx_vrpt_instance_mogul_torsion_outliers.atom_1         C11
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_pdbx_vrpt_instance_mogul_torsion_outliers.local_density  0.00
#
loop_
_pdbx_vrpt_software.ordinal
_pdbx_vrpt_software.name
_pdbx_vrpt_software.version
_pdbx_vrpt_software.success_y_or_n
1  molprobity   4.02b-467                                                             Y  
2  mogul        "1.8.4, CSD as541be (2020)"                                           Y  
3  percentiles  "20191225.v01 (using entries in the PDB archive December 25th 2019)"  Y  
##
